65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_3116 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  556  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  54.78 
 
 
277 aa  292  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  54.91 
 
 
277 aa  291  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  55.47 
 
 
288 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  55.27 
 
 
278 aa  284  9e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  55.47 
 
 
288 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  54.78 
 
 
281 aa  278  8e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  53.31 
 
 
272 aa  266  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  52.27 
 
 
280 aa  259  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  50.36 
 
 
284 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  50.18 
 
 
278 aa  258  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  53.05 
 
 
297 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  49.45 
 
 
279 aa  238  6.999999999999999e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  50.57 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  48.9 
 
 
279 aa  226  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  48.82 
 
 
287 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  44.15 
 
 
282 aa  219  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  44.71 
 
 
298 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  48.82 
 
 
276 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  43.19 
 
 
261 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  40.58 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  48.43 
 
 
276 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  46.86 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  44.86 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  48.43 
 
 
276 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  44.44 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  42.45 
 
 
282 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  43.64 
 
 
282 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  39.93 
 
 
282 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  45.8 
 
 
285 aa  198  6e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  44.78 
 
 
281 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  45.9 
 
 
293 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  38.43 
 
 
291 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  44.27 
 
 
272 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  41.06 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  40.45 
 
 
267 aa  185  8e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  39.56 
 
 
266 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  38.87 
 
 
280 aa  179  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  36.23 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  38.06 
 
 
268 aa  178  9e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  35.21 
 
 
275 aa  175  9e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  36.4 
 
 
275 aa  171  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  43.08 
 
 
263 aa  169  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  37.97 
 
 
271 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  35.79 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  40.16 
 
 
286 aa  145  6e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  31.64 
 
 
256 aa  116  5e-25  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  29.56 
 
 
288 aa  112  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  29.43 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  27.31 
 
 
287 aa  95.5  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  27.78 
 
 
288 aa  92.8  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  28.25 
 
 
286 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  27.88 
 
 
286 aa  89.4  5e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  28.63 
 
 
288 aa  89.4  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  27.84 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  27.48 
 
 
290 aa  87  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  27.68 
 
 
287 aa  85.9  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  22.31 
 
 
275 aa  55.8  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  22.92 
 
 
288 aa  48.5  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  24.9 
 
 
286 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  31.85 
 
 
282 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0779  periplasmic solute-binding protein-like protein  22.84 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  27.09 
 
 
289 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  23.08 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  29.71 
 
 
292 aa  42.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>