56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1281 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  65.26 
 
 		 284 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  65.68 
 
 		 294 aa  363  1e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  59.78 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  49.26 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  32.58 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  37.26 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  34.93 
 
 		 273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  34.8 
 
 		 278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  33.33 
 
 		 283 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  32.85 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  32.61 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  35.89 
 
 		 284 aa  135  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  34.06 
 
 		 278 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  33.09 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  33.46 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  32.73 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  34.47 
 
 		 281 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  32.97 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  35.16 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  30.6 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  32.26 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  27.57 
 
 		 275 aa  118  9e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  30.53 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  32.35 
 
 		 289 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  31.27 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  30.47 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  30 
 
 		 500 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  33.45 
 
 		 283 aa  102  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  33.58 
 
 		 304 aa  102  8e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  31.46 
 
 		 280 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  26.28 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  26.26 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  29.86 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  26.77 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  25.45 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  26.94 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  23.68 
 
 		 245 aa  65.1  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  27.24 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  25.29 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  26.74 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  23.95 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  50.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  26.16 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  23.81 
 
 		 275 aa  46.2  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  25.14 
 
 		 266 aa  44.7  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  29.48 
 
 		 279 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  29.03 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  31.58 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  24.32 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>