72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4475 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  555  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  94.35 
 
 		 304 aa  495  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  73.29 
 
 		 282 aa  386  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  64.68 
 
 		 296 aa  343  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  66.42 
 
 		 289 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  69.85 
 
 		 280 aa  335  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  64.36 
 
 		 292 aa  332  3e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  42.91 
 
 		 275 aa  231  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  34.7 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  37.02 
 
 		 274 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  34.75 
 
 		 273 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 284 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  37.7 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  36.63 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  33.21 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  35.04 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  32.45 
 
 		 273 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  32.71 
 
 		 273 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  35.02 
 
 		 294 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  33.96 
 
 		 273 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  31.84 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  31.73 
 
 		 286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  29.1 
 
 		 253 aa  129  6e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  32.3 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  32.61 
 
 		 278 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  35.64 
 
 		 294 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  34.16 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  32.46 
 
 		 284 aa  119  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  33.45 
 
 		 282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  32.83 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  30.6 
 
 		 275 aa  113  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  29.46 
 
 		 275 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  26.69 
 
 		 500 aa  106  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  30.74 
 
 		 298 aa  96.3  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  33.58 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  27.76 
 
 		 281 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  30.11 
 
 		 626 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  25.49 
 
 		 246 aa  89.4  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  30.74 
 
 		 626 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  30.92 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 626 aa  85.9  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 625 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  22.48 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  22.02 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  22.66 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  25.6 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  25.6 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  25.6 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  19.55 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  25.56 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  21.88 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1032  periplasmic solute-binding protein-like protein  29.41 
 
 		 278 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.743495  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  21.27 
 
 		 227 aa  48.9  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  23.33 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4566  taurine transporter substrate binding subunit  28.37 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  25.64 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0838  taurine transporter substrate binding subunit  29.81 
 
 		 320 aa  45.8  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  27.54 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0389  taurine transporter substrate binding subunit  29.47 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  26.86 
 
 		 279 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00315  taurine transporter subunit  29.47 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  25.65 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  38.18 
 
 		 221 aa  44.3  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00319  hypothetical protein  29.47 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0394  taurine transporter substrate binding subunit  29.47 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.560594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3263  taurine transporter substrate binding subunit  29.47 
 
 		 320 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  28.65 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0440  taurine transporter substrate binding subunit  29.47 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0428  taurine transporter substrate binding subunit  29.47 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3242  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  29.47 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>