57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0549 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  596  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  74.91 
 
 		 284 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  65.68 
 
 		 282 aa  363  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  61.62 
 
 		 291 aa  338  5e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  52.57 
 
 		 286 aa  263  4e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  37.77 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  32.85 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  39.49 
 
 		 286 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  37.91 
 
 		 273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  37.27 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  36.46 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  36.6 
 
 		 283 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  37.09 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  37.88 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  34.06 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  31.79 
 
 		 296 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  34.66 
 
 		 278 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  29.62 
 
 		 275 aa  139  7e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  36.63 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  32.47 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  33.57 
 
 		 275 aa  135  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  37.68 
 
 		 284 aa  133  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  34.05 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  33.8 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  33.8 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  33.45 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  35.11 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  29 
 
 		 500 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  35.57 
 
 		 304 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  28.73 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  33.2 
 
 		 280 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  32.81 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  25.98 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  29.37 
 
 		 298 aa  86.7  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  24.87 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  28.15 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  30.74 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 626 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  27.31 
 
 		 626 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  23.46 
 
 		 227 aa  51.6  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  27.16 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  30.87 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  28.48 
 
 		 239 aa  50.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  22.83 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  24.03 
 
 		 221 aa  49.7  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  26.38 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  24.81 
 
 		 280 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  30.92 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  24.82 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  25.4 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  25.86 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>