60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0613 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0613  protein of unknown function DUF191  100 
 
 
288 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.6811699999999996e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0599  protein of unknown function DUF191  96.88 
 
 
288 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000197308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0686  hypothetical protein  69.92 
 
 
277 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3380  hypothetical protein  69.12 
 
 
281 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0657  protein of unknown function DUF191  64.84 
 
 
277 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.886624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  69.06 
 
 
278 aa  361  9e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3279  hypothetical protein  63.9 
 
 
284 aa  348  5e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  57.14 
 
 
272 aa  299  4e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1187  protein of unknown function DUF191  54.71 
 
 
297 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.195086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0799  hypothetical protein  52.59 
 
 
278 aa  275  8e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732287  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  53.9 
 
 
280 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1810  hypothetical protein  54.78 
 
 
279 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.24214  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3116  hypothetical protein  55.47 
 
 
276 aa  268  8e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00331427  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1277  hypothetical protein  51.47 
 
 
282 aa  266  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0552  hypothetical protein  51.09 
 
 
307 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00285947  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1815  hypothetical protein  53.88 
 
 
279 aa  256  4e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  49.02 
 
 
261 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2176  hypothetical protein  53.73 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1615  hypothetical protein  53.33 
 
 
287 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.702514 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1773  protein of unknown function DUF191  53.73 
 
 
276 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5858  hypothetical protein  48.87 
 
 
264 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1702  protein of unknown function DUF191  53.73 
 
 
276 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4152  protein of unknown function DUF191  43.68 
 
 
281 aa  236  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00371107 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3234  hypothetical protein  44.93 
 
 
282 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0260  hypothetical protein  44.4 
 
 
282 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3946  hypothetical protein  46.02 
 
 
320 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4337  hypothetical protein  46.02 
 
 
298 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4422  hypothetical protein  48.9 
 
 
281 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.928924  normal  0.490091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4199  protein of unknown function DUF191  46.35 
 
 
282 aa  225  7e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0105  hypothetical protein  45.45 
 
 
304 aa  225  9e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0151  hypothetical protein  50.37 
 
 
293 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0137772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8091  protein of unknown function DUF191  48.28 
 
 
272 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1278  protein of unknown function DUF191  46.01 
 
 
285 aa  215  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1029  protein of unknown function DUF191  40 
 
 
275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  39.63 
 
 
280 aa  209  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0462  hypothetical protein  41.89 
 
 
268 aa  202  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.104402  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0830  hypothetical protein  41.51 
 
 
266 aa  202  5e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0535  hypothetical protein  42.16 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.766739  normal  0.0869709 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1444  hypothetical protein  40.75 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.111813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3445  hypothetical protein  38.15 
 
 
291 aa  194  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1581  protein of unknown function DUF191  41.33 
 
 
271 aa  189  5e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1608  hypothetical protein  37.08 
 
 
266 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.384595 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  37.08 
 
 
280 aa  186  5e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0746  hypothetical protein  33.46 
 
 
275 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.227567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2413  protein of unknown function DUF191  37.31 
 
 
286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113534 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3010  protein of unknown function DUF191  36.92 
 
 
263 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2237  protein of unknown function DUF191  32.92 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0533  hypothetical protein  30.86 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0340  hypothetical protein  31.43 
 
 
288 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2098  S-ribosylhomocysteine lyase (autoinducer-2 productionprotein LuxS; AI-2 synthesis protein)  32.94 
 
 
290 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.19682  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0202  hypothetical protein  31.3 
 
 
288 aa  106  4e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0154  conserved hypothetical protein (DUF191 domain protein)  30.66 
 
 
287 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1670  hypothetical protein  29.07 
 
 
286 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1846  hypothetical protein  29.07 
 
 
286 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0620  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha (succinyl-CoA synthetase subunit alpha) (SCS-alpha)  30.55 
 
 
290 aa  100  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2004  hypothetical protein  31.18 
 
 
287 aa  99.4  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0715126  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2048  hypothetical protein  29.07 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.343897  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0049  protein of unknown function DUF191  23.1 
 
 
288 aa  61.6  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0779  periplasmic solute-binding protein-like protein  24.7 
 
 
288 aa  50.4  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.124322 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  25.4 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>