64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1828 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  563  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  65.07 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  65.07 
 
 		 273 aa  360  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  60.07 
 
 		 278 aa  351  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  60.44 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2019  hypothetical protein  53.23 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000126009  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  45.22 
 
 		 275 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  44.69 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  38.55 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  37.87 
 
 		 275 aa  192  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1684  protein of unknown function DUF178  39.71 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37152  normal  0.0545978 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  35.27 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1644  protein of unknown function DUF178  36.79 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000230581  hitchhiker  0.000000480374 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1090  hypothetical protein  35.19 
 
 		 274 aa  166  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1276  hypothetical protein  32.72 
 
 		 278 aa  160  3e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  31.52 
 
 		 284 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  35.88 
 
 		 286 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0670  protein of unknown function DUF178  35.82 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8062  protein of unknown function DUF178  31.27 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0757  protein of unknown function DUF752  35.56 
 
 		 500 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  34.06 
 
 		 294 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1227  hypothetical protein  33.21 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0783  protein of unknown function DUF178  34.52 
 
 		 281 aa  145  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16966  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1190  protein of unknown function DUF178  33.45 
 
 		 284 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.621312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4475  hypothetical protein  34.25 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4076  hypothetical protein  33.86 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0359636 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1281  protein of unknown function DUF178  32.85 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  30.45 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0261  hypothetical protein  31.95 
 
 		 280 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.611921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  34.48 
 
 		 271 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6108  hypothetical protein  29.14 
 
 		 289 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  30.19 
 
 		 253 aa  112  5e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  30.37 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  32.95 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2099  hypothetical protein  30.15 
 
 		 294 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0571299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4038  protein of unknown function DUF178  29.18 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.063784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0786  hypothetical protein  30.71 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0287484  normal  0.781608 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2810  protein of unknown function DUF178  28.32 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.446803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  29.26 
 
 		 626 aa  82.4  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1882  radical SAM domain-containing protein  25.76 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  29.32 
 
 		 625 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 626 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0543  hypothetical protein  28.46 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.040615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  27.78 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  30.89 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0237  hypothetical protein  26.74 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0252  hypothetical protein  26.74 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0711  hypothetical protein  26.37 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  25.5 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0885  hypothetical protein  25 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.331492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1302  hypothetical protein  32.78 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0440  hypothetical protein  32.22 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1477  hypothetical protein  33.15 
 
 		 223 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2834  protein of unknown function DUF191  25.28 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185622  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  23.27 
 
 		 246 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1558  hypothetical protein  27.41 
 
 		 227 aa  52  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0858753  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0346  hypothetical protein  29.78 
 
 		 230 aa  51.2  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2188  protein of unknown function DUF178  22.69 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.745567  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1168  protein of unknown function DUF191  22.4 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1291  conserved hypothetical protein (DUF178 domain protein)  25.88 
 
 		 221 aa  45.8  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1988  protein of unknown function DUF191  26.7 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  22.83 
 
 		 238 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0454  hypothetical protein  24.69 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6959  protein of unknown function DUF191  24.32 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>