271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0371 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  97.92 
 
 
626 aa  1213    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1280    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  87.38 
 
 
625 aa  1113    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  97.6 
 
 
626 aa  1209    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  56.52 
 
 
371 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  55.3 
 
 
360 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  55.23 
 
 
386 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  51.41 
 
 
355 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  52.79 
 
 
381 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  52.69 
 
 
354 aa  372  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  54.25 
 
 
375 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  52.27 
 
 
353 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  51.01 
 
 
369 aa  365  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  51.44 
 
 
355 aa  364  3e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  51.58 
 
 
354 aa  362  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  52.29 
 
 
355 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  49.71 
 
 
358 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  51.59 
 
 
355 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  48.58 
 
 
363 aa  348  1e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  52.49 
 
 
348 aa  348  2e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  51.46 
 
 
364 aa  346  8e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  52.59 
 
 
356 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  49.12 
 
 
345 aa  343  5e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  50.58 
 
 
357 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  48.41 
 
 
348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  48.26 
 
 
348 aa  340  7e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  50.43 
 
 
348 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  50.43 
 
 
348 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  47.85 
 
 
394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  50.14 
 
 
357 aa  337  5e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  47.56 
 
 
396 aa  336  7e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  50.14 
 
 
348 aa  335  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  47.98 
 
 
349 aa  335  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 
350 aa  334  3e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  50 
 
 
357 aa  334  4e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  47.14 
 
 
399 aa  332  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  48.7 
 
 
348 aa  331  3e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  48.45 
 
 
402 aa  327  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  45.64 
 
 
359 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  47.44 
 
 
395 aa  320  3e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  45.51 
 
 
385 aa  319  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  43.63 
 
 
356 aa  316  6e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  46.46 
 
 
374 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  49.13 
 
 
347 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  49.28 
 
 
380 aa  311  2e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  44.99 
 
 
360 aa  311  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  45.24 
 
 
352 aa  311  2.9999999999999997e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 
374 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  44.94 
 
 
377 aa  304  4.0000000000000003e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  44.35 
 
 
404 aa  303  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  47.13 
 
 
515 aa  300  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  44.66 
 
 
379 aa  297  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  45.68 
 
 
393 aa  296  8e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 
358 aa  265  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 
353 aa  262  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 
372 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 
347 aa  259  7e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
365 aa  250  6e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 
348 aa  249  9e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  38.76 
 
 
354 aa  248  2e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 
368 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  38.72 
 
 
387 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  41.29 
 
 
360 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 
364 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 
358 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 
419 aa  243  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 
358 aa  243  6e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  40.4 
 
 
362 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
361 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 
372 aa  236  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  37.08 
 
 
371 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  40.44 
 
 
353 aa  235  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  38.57 
 
 
367 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 
359 aa  233  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  36.08 
 
 
354 aa  232  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  36.71 
 
 
368 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  34.57 
 
 
353 aa  231  3e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  35.57 
 
 
350 aa  231  3e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.99 
 
 
872 aa  230  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  37.34 
 
 
354 aa  229  9e-59  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  37.66 
 
 
354 aa  229  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 
360 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  38.87 
 
 
358 aa  228  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 
367 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  37.34 
 
 
354 aa  227  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 
358 aa  227  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  37.8 
 
 
376 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 
389 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  36.07 
 
 
380 aa  223  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  37.54 
 
 
360 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  35.21 
 
 
373 aa  223  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 
435 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  36 
 
 
354 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  35.03 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 
389 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  33.7 
 
 
429 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  37.64 
 
 
792 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  37.82 
 
 
353 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 
859 aa  221  5e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>