268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4068 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  80.79 
 
 		 385 aa  643    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  95.43 
 
 		 396 aa  775    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 394 aa  814    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  72.41 
 
 		 395 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  73.21 
 
 		 515 aa  568  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  67.59 
 
 		 404 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  68.98 
 
 		 380 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  51 
 
 		 355 aa  366  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  47.43 
 
 		 356 aa  354  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  49.29 
 
 		 625 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  48.97 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  47.14 
 
 		 371 aa  338  7e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  48.41 
 
 		 626 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  48.12 
 
 		 626 aa  334  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  47.01 
 
 		 386 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  48.12 
 
 		 626 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 		 357 aa  330  2e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  44 
 
 		 355 aa  329  4e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  49.43 
 
 		 356 aa  329  7e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  45.94 
 
 		 381 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  48.22 
 
 		 375 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  43.93 
 
 		 352 aa  322  7e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  44.03 
 
 		 358 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  43.54 
 
 		 359 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  45.58 
 
 		 355 aa  320  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  44.25 
 
 		 369 aa  319  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  45.06 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  45.01 
 
 		 354 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  44.23 
 
 		 364 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  44.41 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  45.74 
 
 		 355 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  44.57 
 
 		 363 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 		 399 aa  313  4.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  43.99 
 
 		 348 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  44.54 
 
 		 357 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  44.79 
 
 		 402 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 		 374 aa  308  9e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  45.32 
 
 		 348 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  43.82 
 
 		 348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  43.73 
 
 		 349 aa  306  6e-82  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  45 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  42.56 
 
 		 345 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 360 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  45.19 
 
 		 348 aa  290  4e-77  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 374 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  45.19 
 
 		 348 aa  289  7e-77  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  43.44 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  44.9 
 
 		 348 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  41.74 
 
 		 359 aa  278  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  40.53 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  41.46 
 
 		 358 aa  265  8.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.7 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  40.48 
 
 		 364 aa  263  3e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 		 368 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  40.6 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  39.4 
 
 		 348 aa  258  9e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.46 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.11 
 
 		 384 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  40.56 
 
 		 379 aa  257  3e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.41 
 
 		 359 aa  256  7e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  37.88 
 
 		 360 aa  256  7e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 373 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  37.47 
 
 		 361 aa  252  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  39.04 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  38.48 
 
 		 376 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  37.19 
 
 		 419 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  39.59 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  39.09 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  37.22 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  32.87 
 
 		 364 aa  237  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  37.11 
 
 		 353 aa  237  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  34.92 
 
 		 367 aa  238  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  34.75 
 
 		 353 aa  233  5e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  34.96 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 388 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  36.08 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  34.75 
 
 		 371 aa  229  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  36.36 
 
 		 388 aa  229  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  33.99 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  34.65 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  33.52 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  34.11 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 		 373 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  34.99 
 
 		 360 aa  226  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  35.03 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 		 391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 372 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  32.87 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>