229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2811 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 402 aa  836    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  52.81 
 
 		 358 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  52.41 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  53.76 
 
 		 369 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  53.54 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  52.82 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  51.01 
 
 		 381 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  51.13 
 
 		 354 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  50.71 
 
 		 355 aa  359  6e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  53.43 
 
 		 355 aa  357  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  50.43 
 
 		 349 aa  356  5e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  52.06 
 
 		 348 aa  354  1e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  49.13 
 
 		 348 aa  352  7e-96  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  49.01 
 
 		 363 aa  350  3e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  49.14 
 
 		 350 aa  349  5e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  47.79 
 
 		 386 aa  348  8e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  50.89 
 
 		 345 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  48.31 
 
 		 371 aa  347  2e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  49.13 
 
 		 360 aa  347  3e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  48.58 
 
 		 625 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  48.86 
 
 		 626 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  50.28 
 
 		 375 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  48.86 
 
 		 626 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  48.86 
 
 		 626 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  47.14 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  47.26 
 
 		 348 aa  342  5e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  46.33 
 
 		 353 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  46.05 
 
 		 364 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  46.72 
 
 		 395 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  49.71 
 
 		 348 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  49.71 
 
 		 348 aa  332  9e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  43.8 
 
 		 352 aa  330  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  49.42 
 
 		 348 aa  330  4e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  44.13 
 
 		 357 aa  328  9e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  44.13 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  44.79 
 
 		 394 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  48.41 
 
 		 348 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 		 385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  45.01 
 
 		 515 aa  319  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  46.11 
 
 		 359 aa  319  5e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  47.28 
 
 		 380 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  44.6 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  45.48 
 
 		 355 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  46.49 
 
 		 357 aa  316  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  43.85 
 
 		 374 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  43.58 
 
 		 356 aa  309  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  42.19 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  46.44 
 
 		 347 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  43.72 
 
 		 377 aa  301  1e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.21 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  43.89 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 374 aa  293  5e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 		 360 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  38.36 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  40.96 
 
 		 373 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  40.91 
 
 		 362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.2 
 
 		 358 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 		 358 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  39.39 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  37.19 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.33 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  41.8 
 
 		 393 aa  262  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  40.84 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 		 391 aa  260  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 386 aa  259  5.0000000000000005e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 359 aa  259  8e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  38.46 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  38.81 
 
 		 373 aa  255  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  37.37 
 
 		 384 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 		 364 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  37.02 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 		 358 aa  253  6e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 347 aa  252  7e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  36.69 
 
 		 371 aa  252  1e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  34.47 
 
 		 350 aa  251  1e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.29 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  37.22 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 348 aa  251  2e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 367 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 396 aa  246  4.9999999999999997e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  41.04 
 
 		 358 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  38.66 
 
 		 372 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  36.77 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  34.46 
 
 		 353 aa  238  2e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  35.03 
 
 		 353 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  34.27 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  37.92 
 
 		 367 aa  236  7e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  34.93 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  34.37 
 
 		 365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  35.67 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>