234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1324 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
348 aa  716    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  85.51 
 
 
364 aa  633  1e-180  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  81.27 
 
 
353 aa  595  1e-169  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  79.59 
 
 
347 aa  586  1e-166  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  59.88 
 
 
358 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  47.23 
 
 
372 aa  350  3e-95  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  44.78 
 
 
355 aa  301  1e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  43.88 
 
 
360 aa  296  4e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  43.62 
 
 
353 aa  291  9e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  42.2 
 
 
354 aa  290  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  42.04 
 
 
386 aa  285  7e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  42.94 
 
 
368 aa  281  8.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  42.64 
 
 
371 aa  281  9e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  41.91 
 
 
357 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  42.34 
 
 
381 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
364 aa  278  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  42.07 
 
 
355 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 
375 aa  275  9e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  42.69 
 
 
358 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  39.13 
 
 
353 aa  270  2e-71  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  41.86 
 
 
354 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  42.01 
 
 
380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  43.09 
 
 
356 aa  268  8e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 
355 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  40.97 
 
 
349 aa  266  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 
369 aa  266  4e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  41.13 
 
 
350 aa  265  7e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  43.77 
 
 
364 aa  265  8e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  40.23 
 
 
348 aa  265  8.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 
360 aa  265  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  40.9 
 
 
395 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  41.59 
 
 
348 aa  264  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  39.17 
 
 
357 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  41.16 
 
 
347 aa  264  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  40.7 
 
 
363 aa  263  4e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  38.87 
 
 
357 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  40 
 
 
356 aa  262  8e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 
352 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 
368 aa  260  3e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  39.7 
 
 
355 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  39.4 
 
 
394 aa  258  8e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  37.93 
 
 
359 aa  258  1e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 
396 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 
350 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  40.41 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  38.4 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  40.51 
 
 
515 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  38.62 
 
 
373 aa  252  5.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  38.11 
 
 
348 aa  252  6e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 
399 aa  252  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  42.11 
 
 
625 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  38.99 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  38.11 
 
 
348 aa  252  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 
345 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  41.62 
 
 
626 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  41.62 
 
 
626 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  41.44 
 
 
626 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  37.46 
 
 
348 aa  248  8e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 
387 aa  242  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  36.94 
 
 
360 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 
361 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  37.71 
 
 
396 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  35.31 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  36.53 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  35.78 
 
 
367 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1325  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
362 aa  239  6.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.270915  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 
373 aa  238  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  36.23 
 
 
358 aa  238  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
388 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 
359 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 
404 aa  238  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 
367 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 
360 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  37.2 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
373 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  38.69 
 
 
374 aa  235  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 
388 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
372 aa  232  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  37.54 
 
 
371 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 
359 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  38.28 
 
 
364 aa  229  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 
374 aa  229  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 
377 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  38.44 
 
 
402 aa  229  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  35.05 
 
 
391 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 
367 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  36.23 
 
 
348 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 
359 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  36.61 
 
 
387 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  36.66 
 
 
376 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  34.72 
 
 
376 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  34.68 
 
 
365 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  33.91 
 
 
356 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  37.04 
 
 
379 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  34.88 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  35.61 
 
 
384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 
367 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  33.73 
 
 
380 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  37.41 
 
 
367 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>