227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1159 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  736    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  52.59 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  52.31 
 
 		 360 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  50.14 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  50.29 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  51.27 
 
 		 364 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  52.82 
 
 		 356 aa  365  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  50.43 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  49.44 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  52.15 
 
 		 360 aa  362  6e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 515 aa  362  6e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  52.37 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  48.58 
 
 		 355 aa  360  3e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  50.14 
 
 		 354 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  47.43 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  46.67 
 
 		 396 aa  352  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  50.28 
 
 		 380 aa  352  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  50.14 
 
 		 352 aa  352  7e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  48.57 
 
 		 363 aa  351  8.999999999999999e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  46.96 
 
 		 371 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  46.88 
 
 		 354 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  44.69 
 
 		 385 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  48.56 
 
 		 355 aa  343  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  47.26 
 
 		 349 aa  342  5e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  47.7 
 
 		 350 aa  342  5.999999999999999e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  48.13 
 
 		 348 aa  342  7e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  46.11 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  51.24 
 
 		 347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  45.82 
 
 		 386 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  48.55 
 
 		 353 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  47.11 
 
 		 359 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 381 aa  332  5e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  46.82 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 		 369 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  46.4 
 
 		 375 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  45.56 
 
 		 625 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  48.41 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  48.7 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  47.51 
 
 		 348 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  48.7 
 
 		 348 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  48.55 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  41 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  44.38 
 
 		 626 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  44.38 
 
 		 626 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  44.38 
 
 		 626 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 		 399 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  43.58 
 
 		 402 aa  287  2e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 358 aa  286  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 		 360 aa  286  4e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.2 
 
 		 358 aa  286  5e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  42.78 
 
 		 373 aa  285  5.999999999999999e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40.74 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  41.97 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.17 
 
 		 360 aa  276  4e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  42.58 
 
 		 367 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 		 374 aa  275  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.73 
 
 		 361 aa  273  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.74 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  38.76 
 
 		 388 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 		 367 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  39.33 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  38.48 
 
 		 388 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 367 aa  263  4e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 348 aa  262  8e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  39 
 
 		 358 aa  262  8.999999999999999e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 364 aa  258  8e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  40.23 
 
 		 353 aa  257  2e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 364 aa  257  2e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  39.76 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 367 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  39.49 
 
 		 362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  38.98 
 
 		 377 aa  253  3e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  36.93 
 
 		 370 aa  249  4e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  36.93 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  36.24 
 
 		 376 aa  248  8e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 		 373 aa  248  8e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  35.99 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.26 
 
 		 373 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  37.71 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  36.03 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  36.65 
 
 		 359 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  36.9 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  36.36 
 
 		 353 aa  242  9e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  39.31 
 
 		 856 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  35.51 
 
 		 353 aa  241  2e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  37.07 
 
 		 358 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 		 386 aa  239  5.999999999999999e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  36.65 
 
 		 372 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  38.87 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 		 350 aa  237  2e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 		 372 aa  236  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>