238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4252 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 435 aa  890    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  64 
 
 		 418 aa  504  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  58 
 
 		 429 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  54.91 
 
 		 863 aa  380  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  54.7 
 
 		 859 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  54.7 
 
 		 859 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  54.7 
 
 		 859 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  55.27 
 
 		 859 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  51.42 
 
 		 842 aa  372  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  53.21 
 
 		 859 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  50.39 
 
 		 875 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  53.89 
 
 		 841 aa  365  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  52.66 
 
 		 857 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  51.83 
 
 		 859 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  55.43 
 
 		 856 aa  363  3e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  53.22 
 
 		 899 aa  362  5.0000000000000005e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  52.38 
 
 		 792 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  52.21 
 
 		 871 aa  359  4e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  48.5 
 
 		 800 aa  356  5e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  52.21 
 
 		 884 aa  356  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  52.15 
 
 		 944 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  50.13 
 
 		 872 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  46.01 
 
 		 419 aa  352  8e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  51.87 
 
 		 852 aa  351  1e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  50.13 
 
 		 867 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  50.14 
 
 		 841 aa  348  1e-94  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  50.25 
 
 		 779 aa  347  3e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  45.45 
 
 		 820 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  49.87 
 
 		 836 aa  336  5.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  48.73 
 
 		 826 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  51.94 
 
 		 860 aa  332  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  51.45 
 
 		 838 aa  330  3e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  49.73 
 
 		 881 aa  330  4e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.11 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  43.59 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  44.63 
 
 		 359 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  43.79 
 
 		 359 aa  312  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  43.63 
 
 		 362 aa  310  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  44.35 
 
 		 370 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  48.39 
 
 		 757 aa  295  1e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  44.14 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  41 
 
 		 364 aa  282  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  47.68 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.23 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  41.32 
 
 		 367 aa  278  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  40.57 
 
 		 358 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  42.98 
 
 		 365 aa  276  4e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  39.5 
 
 		 362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  41.44 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.45 
 
 		 384 aa  272  7e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.02 
 
 		 737 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  42.02 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.74 
 
 		 741 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.3 
 
 		 737 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  40.4 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  39.28 
 
 		 361 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  39.47 
 
 		 391 aa  262  8.999999999999999e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  38.63 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.54 
 
 		 382 aa  257  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  37.04 
 
 		 376 aa  255  9e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  41.01 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 		 365 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  39.52 
 
 		 386 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 358 aa  252  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  38.95 
 
 		 375 aa  251  2e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  36.27 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  36.27 
 
 		 384 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 354 aa  248  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  41.29 
 
 		 361 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  37.99 
 
 		 360 aa  247  4e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 355 aa  246  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 362 aa  246  8e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  38.31 
 
 		 359 aa  245  9e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 		 359 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  36.99 
 
 		 386 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  35.94 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 373 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  37.74 
 
 		 348 aa  238  1e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  37.15 
 
 		 352 aa  238  1e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  35.96 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 		 345 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  34.84 
 
 		 367 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 625 aa  235  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  39.12 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 		 350 aa  233  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  38.02 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  36.68 
 
 		 371 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.74 
 
 		 349 aa  231  2e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  36.24 
 
 		 356 aa  227  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  37.87 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  36.5 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>