260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0769 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.67 
 
 
872 aa  1115    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  48.85 
 
 
826 aa  679    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  68.06 
 
 
871 aa  1146    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  66.12 
 
 
867 aa  1133    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  49.16 
 
 
811 aa  677    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  52.48 
 
 
779 aa  707    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  67.57 
 
 
899 aa  1102    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  48.7 
 
 
820 aa  724    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.47 
 
 
875 aa  1110    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  63.47 
 
 
859 aa  1066    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  50.37 
 
 
792 aa  712    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  64.85 
 
 
838 aa  1045    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  72.62 
 
 
859 aa  1214    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  100 
 
 
884 aa  1776    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  69.62 
 
 
857 aa  1189    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  64.76 
 
 
842 aa  1071    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  66.67 
 
 
852 aa  1137    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  64.47 
 
 
841 aa  1058    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  69.37 
 
 
881 aa  1149    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  63.47 
 
 
859 aa  1066    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  64.48 
 
 
859 aa  1056    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  64.93 
 
 
863 aa  1088    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  63.27 
 
 
856 aa  1054    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  63.47 
 
 
859 aa  1068    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  63.88 
 
 
859 aa  1043    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  66.99 
 
 
860 aa  1089    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  67.38 
 
 
836 aa  1125    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  44.25 
 
 
841 aa  605  1.0000000000000001e-171  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  72.75 
 
 
944 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  44.42 
 
 
757 aa  537  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  60.88 
 
 
416 aa  496  1e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  64.75 
 
 
430 aa  473  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  57.51 
 
 
800 aa  422  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  51.15 
 
 
429 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  52.21 
 
 
435 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
418 aa  364  4e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  47.57 
 
 
392 aa  357  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  51.8 
 
 
380 aa  343  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  50.14 
 
 
386 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  44.38 
 
 
419 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  44.38 
 
 
359 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  44.67 
 
 
370 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  41.97 
 
 
362 aa  313  7.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  48.79 
 
 
453 aa  310  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  41.5 
 
 
359 aa  309  2.0000000000000002e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  48.39 
 
 
376 aa  308  3e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  43.23 
 
 
359 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  46.79 
 
 
352 aa  302  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  46.48 
 
 
352 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  44.97 
 
 
381 aa  294  5e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  45.4 
 
 
352 aa  290  8e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  45.26 
 
 
380 aa  288  2e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  41.99 
 
 
390 aa  288  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  45.22 
 
 
365 aa  286  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  44.41 
 
 
351 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.14 
 
 
382 aa  284  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  42.44 
 
 
391 aa  284  5.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  46.06 
 
 
358 aa  283  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  51.1 
 
 
419 aa  282  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  43.12 
 
 
358 aa  281  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  39.77 
 
 
358 aa  281  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  44.02 
 
 
362 aa  280  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  45.16 
 
 
356 aa  279  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  43.2 
 
 
372 aa  276  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  41.3 
 
 
376 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.7 
 
 
741 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  46.78 
 
 
386 aa  275  4.0000000000000004e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.64 
 
 
737 aa  274  6e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.97 
 
 
737 aa  273  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  41.79 
 
 
358 aa  273  7e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  40.95 
 
 
384 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  40.95 
 
 
384 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  42.69 
 
 
398 aa  271  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.69 
 
 
565 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  45.05 
 
 
329 aa  270  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  42.36 
 
 
367 aa  268  2e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  43.5 
 
 
325 aa  267  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.13 
 
 
331 aa  265  4e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  42.81 
 
 
366 aa  262  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  43.88 
 
 
330 aa  261  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  40.7 
 
 
384 aa  260  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  45.78 
 
 
327 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 
362 aa  249  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 
360 aa  244  5e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  39.07 
 
 
361 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  41.69 
 
 
321 aa  241  4e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.04 
 
 
356 aa  241  5e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  41.56 
 
 
362 aa  238  4e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.98 
 
 
389 aa  238  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.62 
 
 
393 aa  236  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  38.19 
 
 
364 aa  233  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3629  conserved hypothetical protein; putative SAM domain  44.83 
 
 
339 aa  230  9e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0222869  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  45.08 
 
 
387 aa  230  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  42.12 
 
 
326 aa  230  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  43.62 
 
 
368 aa  229  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 
355 aa  228  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  40.41 
 
 
358 aa  228  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  43.37 
 
 
355 aa  228  6e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  41.88 
 
 
360 aa  225  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  35.43 
 
 
361 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>