275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0593 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 390 aa  801    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  41.29 
 
 		 800 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  43.36 
 
 		 881 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  38.38 
 
 		 792 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  40.06 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  38.12 
 
 		 838 aa  307  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  40.06 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  39.02 
 
 		 860 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.62 
 
 		 419 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  38.44 
 
 		 820 aa  294  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  40.62 
 
 		 836 aa  292  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  38.82 
 
 		 867 aa  292  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  44.9 
 
 		 352 aa  289  7e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  39.14 
 
 		 871 aa  287  2e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  42.55 
 
 		 857 aa  287  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  40.78 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  42.26 
 
 		 852 aa  286  4e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.72 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  41.99 
 
 		 884 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 		 859 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  38.16 
 
 		 779 aa  280  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  43.9 
 
 		 352 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  44.22 
 
 		 352 aa  279  6e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.5 
 
 		 863 aa  278  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  40.12 
 
 		 856 aa  277  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  40.24 
 
 		 826 aa  277  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  38.3 
 
 		 841 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  40.35 
 
 		 842 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  39.94 
 
 		 859 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  41.5 
 
 		 351 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 		 430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.57 
 
 		 875 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  39.63 
 
 		 859 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  39.63 
 
 		 859 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  41.46 
 
 		 859 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  41.14 
 
 		 859 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  43.65 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.32 
 
 		 872 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  38.46 
 
 		 944 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  35.61 
 
 		 811 aa  256  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  38.1 
 
 		 841 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  38.76 
 
 		 899 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.65 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  40 
 
 		 325 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  37.3 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  36.24 
 
 		 757 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  42.86 
 
 		 330 aa  242  9e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37.54 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  36.12 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  37.94 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  38.37 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  39.87 
 
 		 331 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.13 
 
 		 565 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 		 329 aa  229  5e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  38.32 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  35.29 
 
 		 336 aa  196  6e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  36.17 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  36.36 
 
 		 340 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.79 
 
 		 741 aa  189  5e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  36.7 
 
 		 318 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  36.7 
 
 		 318 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  30.85 
 
 		 737 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  34.15 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  35.53 
 
 		 307 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  30.68 
 
 		 737 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  35.47 
 
 		 325 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  25.71 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  25.99 
 
 		 356 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  27.12 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  26.77 
 
 		 384 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  26.6 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  24.65 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  26.24 
 
 		 347 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 357 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  23.72 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 365 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  22.08 
 
 		 626 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  26.99 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  22.26 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  22.91 
 
 		 364 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 		 404 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  23.84 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  23.84 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  27.36 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 348 aa  65.1  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  22.15 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  24.44 
 
 		 384 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  21.94 
 
 		 371 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  24.13 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  25.16 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  23.74 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  21.17 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>