117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1894 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 387 aa  777    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  65.45 
 
 		 389 aa  500  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  65.63 
 
 		 372 aa  494  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  63.66 
 
 		 393 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  70.71 
 
 		 368 aa  479  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  51.13 
 
 		 327 aa  300  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  48.84 
 
 		 565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  46.03 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  47.83 
 
 		 792 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.81 
 
 		 331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  47.08 
 
 		 800 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  38.94 
 
 		 392 aa  269  7e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  45.83 
 
 		 380 aa  263  4.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  44.04 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.03 
 
 		 863 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  45.82 
 
 		 321 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  44.63 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  43.75 
 
 		 820 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  45.91 
 
 		 811 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  47.27 
 
 		 838 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.89 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.12 
 
 		 875 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  37.3 
 
 		 390 aa  247  3e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.28 
 
 		 872 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  45.89 
 
 		 852 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  44.79 
 
 		 826 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  39.68 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  45.91 
 
 		 860 aa  242  6e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  43.77 
 
 		 779 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  46.03 
 
 		 836 aa  242  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  39.26 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  40.32 
 
 		 352 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  42.09 
 
 		 859 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  42.09 
 
 		 859 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  41.81 
 
 		 859 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  44.14 
 
 		 871 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  39.2 
 
 		 352 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  44.27 
 
 		 857 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  40.11 
 
 		 842 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  38.41 
 
 		 351 aa  237  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  43.04 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  42.41 
 
 		 841 aa  236  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  43.95 
 
 		 867 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  44.9 
 
 		 859 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  42.63 
 
 		 859 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  40.11 
 
 		 856 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  45.31 
 
 		 430 aa  232  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.3 
 
 		 419 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  44.73 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.01 
 
 		 859 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  43.95 
 
 		 881 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  45.08 
 
 		 884 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  47.6 
 
 		 944 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 		 757 aa  218  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  47.28 
 
 		 899 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  40.06 
 
 		 841 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.22 
 
 		 741 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.81 
 
 		 737 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  35.5 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  33.74 
 
 		 318 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  38.26 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.76 
 
 		 737 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  35.81 
 
 		 318 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  39.67 
 
 		 336 aa  176  5e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  34.27 
 
 		 340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  35.35 
 
 		 307 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  33.67 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  24.38 
 
 		 356 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  23.87 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 368 aa  59.7  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  25.73 
 
 		 380 aa  57.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  25.76 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  26.91 
 
 		 367 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  22.63 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  28.28 
 
 		 341 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 		 394 aa  52.8  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  27.59 
 
 		 341 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  22.93 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  23.86 
 
 		 376 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 		 358 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  24.61 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  20.5 
 
 		 385 aa  50.4  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  22.39 
 
 		 361 aa  50.1  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 365 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  25 
 
 		 626 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  24.81 
 
 		 333 aa  49.7  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  25.99 
 
 		 360 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  24.1 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 362 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 368 aa  47.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 626 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 626 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  27.59 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  25.7 
 
 		 333 aa  46.6  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>