More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1394 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  100 
 
 		 333 aa  686    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  88.79 
 
 		 331 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  75.94 
 
 		 335 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  74.44 
 
 		 345 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  74.44 
 
 		 345 aa  509  1e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  73.42 
 
 		 332 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  66.67 
 
 		 335 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  66.99 
 
 		 335 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  69.77 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  67.44 
 
 		 314 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  66.35 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  65.05 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  64.72 
 
 		 328 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  64.17 
 
 		 333 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  64.08 
 
 		 332 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  64.72 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  64.72 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  64.97 
 
 		 337 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  59.87 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  59.87 
 
 		 322 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  58.81 
 
 		 339 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  59.87 
 
 		 336 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  60.06 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  59.87 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  59.87 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  59.12 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  58.33 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  56.01 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  56.55 
 
 		 362 aa  375  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  58.03 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  57.89 
 
 		 337 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  57.28 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  54.09 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  57.47 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  58.71 
 
 		 333 aa  362  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  56.49 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  56.49 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  54.98 
 
 		 350 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  55.27 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  51.75 
 
 		 350 aa  352  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  53.89 
 
 		 352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  56.96 
 
 		 339 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  56.96 
 
 		 339 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  56.96 
 
 		 339 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  56.96 
 
 		 339 aa  352  8e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  54.31 
 
 		 359 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  56.91 
 
 		 330 aa  351  1e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  54.31 
 
 		 362 aa  350  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  53.18 
 
 		 356 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  56.96 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  53.53 
 
 		 350 aa  349  3e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  55.77 
 
 		 331 aa  349  4e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  54.63 
 
 		 354 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  53.89 
 
 		 352 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  56.63 
 
 		 339 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  54.04 
 
 		 352 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  56.63 
 
 		 340 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  53.58 
 
 		 352 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  54.31 
 
 		 360 aa  347  1e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  52.98 
 
 		 338 aa  347  2e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  55.74 
 
 		 335 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  52.55 
 
 		 335 aa  345  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  53.89 
 
 		 437 aa  345  6e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  52.35 
 
 		 352 aa  345  8e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  56.13 
 
 		 340 aa  344  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  51.61 
 
 		 367 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  53.02 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  54.17 
 
 		 334 aa  344  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  53.61 
 
 		 351 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  53 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1167  biotin synthase  57.05 
 
 		 370 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.893176  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  52.52 
 
 		 352 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  52.05 
 
 		 351 aa  342  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  52.52 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  55.52 
 
 		 345 aa  341  8e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  53.97 
 
 		 354 aa  341  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  52.23 
 
 		 374 aa  341  1e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  54.17 
 
 		 345 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  51.9 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  53.46 
 
 		 345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  50.61 
 
 		 332 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  54.07 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  53.5 
 
 		 352 aa  339  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  56.21 
 
 		 353 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  52.87 
 
 		 354 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  54.07 
 
 		 349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  56.55 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  52.87 
 
 		 352 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  51.35 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  52.72 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  51.35 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  51.35 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  51.35 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  55.52 
 
 		 342 aa  335  5.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  52.65 
 
 		 350 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  53.5 
 
 		 346 aa  334  1e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  51.27 
 
 		 353 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  52.08 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  52.08 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  52.08 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>