More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4622 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  100 
 
 		 332 aa  692    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  67.3 
 
 		 326 aa  471  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  65.4 
 
 		 337 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  67.52 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  64.22 
 
 		 330 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  59.28 
 
 		 363 aa  431  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  62.11 
 
 		 375 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  60.25 
 
 		 335 aa  421  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  59.63 
 
 		 362 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  60.63 
 
 		 333 aa  420  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  57.46 
 
 		 368 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  55.56 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  53.56 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  54.6 
 
 		 320 aa  363  1e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  54.46 
 
 		 345 aa  361  8e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  54.46 
 
 		 345 aa  358  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  54.46 
 
 		 345 aa  358  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  53.29 
 
 		 340 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  52.41 
 
 		 437 aa  358  7e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  54.95 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  355  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  51.7 
 
 		 350 aa  355  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  54.78 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  54.78 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  355  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  54.63 
 
 		 346 aa  354  8.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  53.67 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  54.37 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  53.21 
 
 		 333 aa  352  4e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  55.27 
 
 		 332 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  51.42 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  52.09 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  53.56 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  55.45 
 
 		 346 aa  351  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  53.97 
 
 		 347 aa  350  1e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  53.12 
 
 		 334 aa  350  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  52.94 
 
 		 354 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  53.35 
 
 		 362 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  54.26 
 
 		 344 aa  349  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  54.78 
 
 		 345 aa  349  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  52.01 
 
 		 328 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  53.35 
 
 		 359 aa  350  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  52.17 
 
 		 331 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  51.44 
 
 		 388 aa  347  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  53.67 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  53.67 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  53.67 
 
 		 350 aa  348  1e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  54.17 
 
 		 346 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  52.53 
 
 		 374 aa  346  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  53.05 
 
 		 350 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  54.14 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  54.14 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  53.35 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  53.35 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  50 
 
 		 324 aa  346  4e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  53.35 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  53.35 
 
 		 350 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  52.73 
 
 		 350 aa  345  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  53.04 
 
 		 350 aa  345  8e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  53.04 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  50.46 
 
 		 364 aa  344  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  52.73 
 
 		 356 aa  344  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  55.08 
 
 		 320 aa  344  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  55.45 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  53 
 
 		 341 aa  343  2e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  53 
 
 		 341 aa  343  2.9999999999999997e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  53.99 
 
 		 354 aa  342  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  54.94 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  51.12 
 
 		 338 aa  341  8e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  52.41 
 
 		 335 aa  341  9e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1719  biotin synthase  53.82 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0119643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  52.09 
 
 		 345 aa  341  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  50.46 
 
 		 353 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  48.47 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  51.9 
 
 		 332 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  52.45 
 
 		 354 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  49.24 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  49.39 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  48.94 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  53 
 
 		 335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  53 
 
 		 335 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  52.08 
 
 		 335 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  49.24 
 
 		 352 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  51.45 
 
 		 345 aa  339  4e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  49.24 
 
 		 352 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  51.27 
 
 		 369 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  49.55 
 
 		 351 aa  338  7e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  51.76 
 
 		 350 aa  338  9e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  49.85 
 
 		 352 aa  338  9e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  49.4 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  49.85 
 
 		 352 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  52.92 
 
 		 351 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>