More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3108 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  100 
 
 		 328 aa  673    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  68.73 
 
 		 330 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  66.56 
 
 		 320 aa  434  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  68.93 
 
 		 333 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  66.45 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  68.9 
 
 		 337 aa  420  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  63.72 
 
 		 335 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  64.42 
 
 		 345 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  63.72 
 
 		 335 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  65.22 
 
 		 341 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  64.42 
 
 		 345 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  64.4 
 
 		 332 aa  408  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  63.87 
 
 		 335 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  63.99 
 
 		 332 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  65.48 
 
 		 331 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  58.82 
 
 		 375 aa  388  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  57.45 
 
 		 330 aa  388  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  58.86 
 
 		 335 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  59.49 
 
 		 335 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  58.04 
 
 		 337 aa  384  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  59.68 
 
 		 340 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  59.12 
 
 		 331 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  64.72 
 
 		 333 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  59.74 
 
 		 345 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  56.33 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  56.01 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  56.01 
 
 		 339 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  56.01 
 
 		 339 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  56.01 
 
 		 336 aa  371  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  56.01 
 
 		 339 aa  371  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  53.99 
 
 		 363 aa  370  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  56.01 
 
 		 322 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  60 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  56.01 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  55.48 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  53 
 
 		 350 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  54.63 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  55.91 
 
 		 364 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  54.46 
 
 		 338 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  55.21 
 
 		 351 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  52.74 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  57.05 
 
 		 360 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  58.58 
 
 		 333 aa  364  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  57.05 
 
 		 361 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  56.47 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  55.41 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  55.21 
 
 		 350 aa  360  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  55.34 
 
 		 374 aa  359  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  54.6 
 
 		 350 aa  359  4e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  52.8 
 
 		 342 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  55.21 
 
 		 350 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  55.21 
 
 		 350 aa  359  4e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  55.21 
 
 		 350 aa  359  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  54.09 
 
 		 352 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  54.34 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  54.66 
 
 		 352 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  53.89 
 
 		 351 aa  355  5e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  60.84 
 
 		 325 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  54.97 
 
 		 345 aa  355  6.999999999999999e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  55.84 
 
 		 339 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  54.02 
 
 		 352 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  54.26 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  56.39 
 
 		 360 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  54.26 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  52.34 
 
 		 368 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  54.14 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1167  biotin synthase  56.07 
 
 		 370 aa  353  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.893176  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  54.26 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  54.26 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  54.26 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  55.56 
 
 		 354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  53.65 
 
 		 369 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  56.01 
 
 		 350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  54.92 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  54.92 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  54.92 
 
 		 339 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  54.81 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  54.81 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  54.34 
 
 		 352 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  54.81 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  55.74 
 
 		 362 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  53.67 
 
 		 352 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  53.65 
 
 		 345 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  54.31 
 
 		 346 aa  351  8e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  55.74 
 
 		 359 aa  351  8e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  55.08 
 
 		 345 aa  351  1e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  53.12 
 
 		 352 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  53.85 
 
 		 351 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  52.5 
 
 		 346 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  53.18 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  52.01 
 
 		 332 aa  350  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  52.37 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  54.29 
 
 		 354 aa  348  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  53.55 
 
 		 315 aa  348  6e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  53.67 
 
 		 345 aa  348  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  54.72 
 
 		 335 aa  348  7e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  56.23 
 
 		 320 aa  348  7e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1786  biotin synthase  57.05 
 
 		 330 aa  348  7e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  53.25 
 
 		 340 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  53 
 
 		 344 aa  348  8e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>