More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12001 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  97.13 
 
 		 335 aa  642    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  100 
 
 		 314 aa  655    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  95.86 
 
 		 335 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  87.58 
 
 		 335 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  67.77 
 
 		 345 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  67.44 
 
 		 345 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  71.33 
 
 		 332 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  67.66 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  68.04 
 
 		 333 aa  434  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  68.03 
 
 		 331 aa  434  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  63.18 
 
 		 320 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  60 
 
 		 328 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  58 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  58 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  57.86 
 
 		 336 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  58 
 
 		 336 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  58 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  58 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  58 
 
 		 339 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  57.53 
 
 		 339 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  59.67 
 
 		 335 aa  362  4e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  59.67 
 
 		 335 aa  362  4e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  59.67 
 
 		 341 aa  361  9e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  58.33 
 
 		 333 aa  361  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  55.85 
 
 		 360 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  55.89 
 
 		 351 aa  358  8e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  57.67 
 
 		 332 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  56.57 
 
 		 361 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  53.62 
 
 		 337 aa  354  8.999999999999999e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  55.22 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  53.44 
 
 		 330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  55.02 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  57.58 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  57.58 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  57.58 
 
 		 339 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  60.42 
 
 		 337 aa  350  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  57.24 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  55.89 
 
 		 320 aa  348  5e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  57.24 
 
 		 339 aa  348  7e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  55.1 
 
 		 345 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  54.82 
 
 		 437 aa  346  3e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  53.16 
 
 		 364 aa  346  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  52.82 
 
 		 345 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  56.57 
 
 		 339 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  56.57 
 
 		 340 aa  346  4e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  51.68 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  52.63 
 
 		 335 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  53.49 
 
 		 350 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  52.19 
 
 		 368 aa  341  8e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  53.87 
 
 		 362 aa  341  9e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  52.68 
 
 		 350 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  55.25 
 
 		 330 aa  341  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  52.86 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  54.18 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  53.87 
 
 		 360 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  52.01 
 
 		 352 aa  339  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  53.54 
 
 		 359 aa  339  4e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  50.82 
 
 		 362 aa  338  7e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  51.49 
 
 		 363 aa  337  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  53.18 
 
 		 338 aa  337  9.999999999999999e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  51.3 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  55.22 
 
 		 345 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  55.9 
 
 		 325 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  50.97 
 
 		 350 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  51.34 
 
 		 356 aa  334  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  51.34 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  53.36 
 
 		 334 aa  334  1e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  52.84 
 
 		 346 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  52.19 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  52.65 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  53 
 
 		 345 aa  333  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  50.17 
 
 		 342 aa  332  4e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  52.35 
 
 		 374 aa  332  5e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  53 
 
 		 345 aa  332  6e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  53 
 
 		 345 aa  332  6e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  54.55 
 
 		 342 aa  331  9e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  52.17 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  52.17 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  52.17 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  52.17 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  52.17 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  51.51 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  52.17 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  52.17 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  52.17 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  52.35 
 
 		 367 aa  329  3e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  51.84 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  51.51 
 
 		 346 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  51.51 
 
 		 346 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  51.51 
 
 		 346 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  53.16 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  52.35 
 
 		 320 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  51.51 
 
 		 346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  51.72 
 
 		 349 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  50.5 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2132  biotin synthase  52.01 
 
 		 342 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  52.35 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  53.06 
 
 		 345 aa  325  4.0000000000000003e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  54.03 
 
 		 336 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  53.67 
 
 		 346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>