More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0419 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  100 
 
 
320 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  70.74 
 
 
345 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  70.42 
 
 
345 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  69.97 
 
 
331 aa  438  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  69.77 
 
 
333 aa  435  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  66.67 
 
 
335 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  65.48 
 
 
332 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  71.2 
 
 
333 aa  429  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  69.5 
 
 
341 aa  427  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  69.28 
 
 
335 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  69.28 
 
 
335 aa  426  1e-118  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  62.7 
 
 
335 aa  427  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  62.7 
 
 
335 aa  426  1e-118  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  66.45 
 
 
328 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  67.74 
 
 
332 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  60.77 
 
 
335 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  63.18 
 
 
314 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  63.96 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  61.51 
 
 
330 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  61.17 
 
 
375 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  67.46 
 
 
337 aa  394  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  64.47 
 
 
330 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  61.97 
 
 
320 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  61.09 
 
 
331 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  61.84 
 
 
360 aa  388  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  58.2 
 
 
364 aa  391  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  56.03 
 
 
362 aa  385  1e-106  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  62.17 
 
 
362 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  60.84 
 
 
339 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  60.84 
 
 
322 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  60.84 
 
 
339 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  60.51 
 
 
345 aa  387  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  60.84 
 
 
336 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  60.13 
 
 
340 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  60.84 
 
 
339 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  62.17 
 
 
359 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  60.84 
 
 
339 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  60.84 
 
 
339 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  60.84 
 
 
336 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  57 
 
 
337 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  54.46 
 
 
350 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  57.33 
 
 
352 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  58.96 
 
 
351 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  57 
 
 
352 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  57.33 
 
 
352 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  57.74 
 
 
351 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  56.49 
 
 
350 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  56.96 
 
 
352 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  55.05 
 
 
363 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  57.33 
 
 
352 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  57.79 
 
 
352 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  58.31 
 
 
361 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  57.98 
 
 
360 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1167  biotin synthase  62.01 
 
 
370 aa  374  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.893176  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  56.96 
 
 
352 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  56.31 
 
 
352 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  57.14 
 
 
352 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  56.03 
 
 
352 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  54.14 
 
 
356 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1129  biotin synthase  60.06 
 
 
342 aa  369  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  57.51 
 
 
437 aa  370  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  56.49 
 
 
350 aa  368  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  60.19 
 
 
339 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  59.93 
 
 
339 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  59.93 
 
 
339 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  59.93 
 
 
339 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  54.95 
 
 
368 aa  370  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  54.14 
 
 
350 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  58.77 
 
 
340 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  55.95 
 
 
338 aa  367  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  58.22 
 
 
344 aa  365  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  59.61 
 
 
339 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  59.28 
 
 
339 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  58.55 
 
 
345 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  54.6 
 
 
332 aa  363  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  57.47 
 
 
350 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  57.47 
 
 
350 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  57.47 
 
 
350 aa  363  2e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  57.93 
 
 
354 aa  362  3e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  57.79 
 
 
350 aa  362  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  54.57 
 
 
334 aa  362  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  58.12 
 
 
345 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  56.82 
 
 
335 aa  361  8e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  54.89 
 
 
345 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  58.55 
 
 
350 aa  359  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  57.1 
 
 
354 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  55.99 
 
 
345 aa  359  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  57.14 
 
 
350 aa  359  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  55.99 
 
 
346 aa  359  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  57.14 
 
 
350 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  57.14 
 
 
350 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  57.14 
 
 
350 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  57.14 
 
 
350 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  54.69 
 
 
351 aa  358  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  56.31 
 
 
346 aa  358  5e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  55.59 
 
 
346 aa  358  6e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  58.55 
 
 
350 aa  358  6e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  55.99 
 
 
346 aa  358  7e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  55.99 
 
 
346 aa  358  7e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  55.99 
 
 
346 aa  358  7e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>