More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_14871 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  99.13 
 
 
345 aa  711    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  100 
 
 
345 aa  715    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  75.16 
 
 
335 aa  518  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  74.52 
 
 
332 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  74.44 
 
 
333 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  74.2 
 
 
331 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  67.09 
 
 
335 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  67.09 
 
 
335 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  70.42 
 
 
320 aa  469  1.0000000000000001e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  67.44 
 
 
314 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  68.27 
 
 
335 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  64.42 
 
 
328 aa  414  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  65.92 
 
 
341 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  65.81 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  65.16 
 
 
333 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  65.81 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  66.33 
 
 
337 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  62.9 
 
 
332 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  60.98 
 
 
320 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  60.98 
 
 
330 aa  379  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  58.63 
 
 
351 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  57.61 
 
 
333 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  58.12 
 
 
322 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  57.78 
 
 
375 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  58.12 
 
 
339 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  58.12 
 
 
336 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  58.12 
 
 
339 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  58.31 
 
 
339 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  58.12 
 
 
336 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  58.12 
 
 
339 aa  381  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  55.84 
 
 
364 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  57.93 
 
 
330 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  56.87 
 
 
437 aa  376  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  57.79 
 
 
339 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  57.65 
 
 
361 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  57.65 
 
 
360 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  55.74 
 
 
337 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  54.84 
 
 
363 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  55.48 
 
 
350 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  53.35 
 
 
350 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  56.17 
 
 
331 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  57.38 
 
 
345 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  57.1 
 
 
340 aa  366  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  56.87 
 
 
345 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  54.55 
 
 
362 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  54.98 
 
 
368 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  53.9 
 
 
352 aa  363  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  57.79 
 
 
339 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  54.37 
 
 
350 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  57.79 
 
 
339 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  57.79 
 
 
339 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  56.39 
 
 
344 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  58.03 
 
 
350 aa  361  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  57.79 
 
 
339 aa  361  9e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  55.74 
 
 
359 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  57.7 
 
 
350 aa  360  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  52.24 
 
 
350 aa  359  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  55.74 
 
 
362 aa  359  3e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  57.47 
 
 
339 aa  359  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  52.24 
 
 
356 aa  359  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  57.47 
 
 
339 aa  358  5e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  57.28 
 
 
340 aa  359  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  53.99 
 
 
338 aa  359  5e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  55.34 
 
 
334 aa  359  5e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  55.41 
 
 
360 aa  358  7e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  55.07 
 
 
349 aa  358  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1167  biotin synthase  55.86 
 
 
370 aa  357  9.999999999999999e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.893176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  54.37 
 
 
354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  54.37 
 
 
354 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  55.37 
 
 
345 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  53.29 
 
 
369 aa  354  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  53.57 
 
 
352 aa  352  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  56.21 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  53.87 
 
 
354 aa  352  7e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  54.19 
 
 
350 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  54.19 
 
 
350 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  54.19 
 
 
350 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  53.57 
 
 
352 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  54.19 
 
 
350 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1786  biotin synthase  56.68 
 
 
330 aa  350  1e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  57.05 
 
 
354 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  52.92 
 
 
352 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1129  biotin synthase  55.28 
 
 
342 aa  349  4e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  56.17 
 
 
353 aa  348  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  53.05 
 
 
342 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  52.58 
 
 
374 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  53.55 
 
 
350 aa  347  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  53.07 
 
 
352 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  53.55 
 
 
350 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  52.41 
 
 
353 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  53.55 
 
 
350 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  53.55 
 
 
350 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  53.55 
 
 
350 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  53.87 
 
 
345 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  52.27 
 
 
352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  53.97 
 
 
345 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2132  biotin synthase  56.35 
 
 
342 aa  346  3e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  56.19 
 
 
336 aa  346  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  52.6 
 
 
352 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  55.84 
 
 
337 aa  346  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.113139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>