More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_11991 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  97.13 
 
 
314 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  97.01 
 
 
335 aa  676    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  100 
 
 
335 aa  696    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  86.57 
 
 
335 aa  593  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  67.09 
 
 
345 aa  476  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  67.41 
 
 
345 aa  477  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  69.33 
 
 
332 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  66.77 
 
 
335 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  66.67 
 
 
331 aa  444  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  66.67 
 
 
333 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  62.7 
 
 
320 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  58.86 
 
 
328 aa  386  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  57.19 
 
 
339 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  58.28 
 
 
335 aa  374  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  57.19 
 
 
339 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  55.17 
 
 
339 aa  375  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  57.19 
 
 
339 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  57.32 
 
 
341 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  58.28 
 
 
335 aa  374  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  57.19 
 
 
336 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  57.19 
 
 
322 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  57.05 
 
 
336 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  53.61 
 
 
337 aa  371  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  55.73 
 
 
333 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  56.72 
 
 
339 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  53.48 
 
 
330 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  54.83 
 
 
375 aa  368  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  56.41 
 
 
332 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  57.84 
 
 
337 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  54.43 
 
 
360 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  55.27 
 
 
320 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  54.75 
 
 
361 aa  364  1e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  53.77 
 
 
351 aa  363  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  52.81 
 
 
333 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  52.85 
 
 
364 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  54.11 
 
 
437 aa  360  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  52.9 
 
 
345 aa  359  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  56.07 
 
 
339 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  56.07 
 
 
339 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  56.07 
 
 
339 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  54.49 
 
 
340 aa  358  8e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  55.74 
 
 
339 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  51.72 
 
 
335 aa  355  5e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  55.26 
 
 
330 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  55.74 
 
 
339 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  52.09 
 
 
350 aa  354  1e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  52.38 
 
 
350 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  53.11 
 
 
345 aa  352  4e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  51.13 
 
 
368 aa  352  4e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  53.44 
 
 
362 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  55.08 
 
 
339 aa  352  5e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  53.99 
 
 
340 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  52.5 
 
 
334 aa  352  7e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  53.44 
 
 
360 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  50.48 
 
 
350 aa  350  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  50.96 
 
 
362 aa  351  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  53.11 
 
 
359 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  50.96 
 
 
363 aa  349  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  51.98 
 
 
338 aa  347  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  51.3 
 
 
352 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  51.6 
 
 
331 aa  347  2e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  50.48 
 
 
356 aa  346  3e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  50.48 
 
 
350 aa  346  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  51.48 
 
 
344 aa  345  8.999999999999999e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  52.26 
 
 
374 aa  344  1e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  49.38 
 
 
340 aa  343  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  52.1 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  50.16 
 
 
342 aa  342  5e-93  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  50.15 
 
 
333 aa  342  8e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  50.16 
 
 
350 aa  340  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  50.48 
 
 
350 aa  341  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  53.44 
 
 
345 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  51.31 
 
 
346 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  50 
 
 
335 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  51.46 
 
 
346 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  51.46 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  51.46 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  51.46 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  51.46 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  51.46 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  52.61 
 
 
345 aa  339  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  51.46 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  51.46 
 
 
346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  52.08 
 
 
332 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  51.6 
 
 
367 aa  339  5e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  52.72 
 
 
336 aa  339  5e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  52.61 
 
 
345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  52.61 
 
 
345 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  51.78 
 
 
353 aa  338  7e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  51.31 
 
 
346 aa  338  9e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  55.9 
 
 
325 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  51.75 
 
 
329 aa  337  9.999999999999999e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  50.98 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  50.98 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  50.98 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  50.98 
 
 
346 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  52.79 
 
 
342 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  50.96 
 
 
369 aa  335  7e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  49.08 
 
 
338 aa  335  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  51.12 
 
 
315 aa  334  1e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>