More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0535 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  100 
 
 		 320 aa  654    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  70.1 
 
 		 330 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  66.56 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  64.82 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  64.59 
 
 		 332 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  64.92 
 
 		 341 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  61.97 
 
 		 320 aa  394  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  64.92 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  64.92 
 
 		 335 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  60.98 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  60.98 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  65.08 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  56.73 
 
 		 375 aa  381  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  58.71 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  55.27 
 
 		 335 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  55.41 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  54.63 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  59.67 
 
 		 331 aa  363  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  54.63 
 
 		 337 aa  363  2e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  58.36 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  52.43 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  57.32 
 
 		 345 aa  359  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  58.03 
 
 		 333 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  53.48 
 
 		 326 aa  352  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  57.23 
 
 		 333 aa  351  7e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  53 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  52.23 
 
 		 333 aa  349  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  55.89 
 
 		 314 aa  348  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  53.05 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  54.09 
 
 		 340 aa  345  7e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  56.09 
 
 		 326 aa  345  7e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  55.52 
 
 		 345 aa  345  8e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  52.09 
 
 		 368 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  50.16 
 
 		 362 aa  343  2.9999999999999997e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  53.85 
 
 		 364 aa  342  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  54.81 
 
 		 339 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  55.13 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  50.95 
 
 		 335 aa  342  7e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  56.09 
 
 		 340 aa  342  7e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  55.37 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  54.49 
 
 		 339 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  54.72 
 
 		 362 aa  341  1e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  54.49 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  55.34 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  54.49 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  54.49 
 
 		 339 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  54.49 
 
 		 336 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  54.49 
 
 		 336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  54.72 
 
 		 359 aa  339  5e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  54.17 
 
 		 322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  54.67 
 
 		 356 aa  338  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  51.92 
 
 		 315 aa  337  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  53.85 
 
 		 334 aa  338  9.999999999999999e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  51.92 
 
 		 315 aa  337  1.9999999999999998e-91  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  50.64 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  53.72 
 
 		 335 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  53.4 
 
 		 353 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  52.24 
 
 		 352 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  54.05 
 
 		 354 aa  331  8e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  55.85 
 
 		 329 aa  331  9e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  50.65 
 
 		 393 aa  331  1e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  54.02 
 
 		 350 aa  331  1e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  54.22 
 
 		 341 aa  330  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  54.28 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  52.77 
 
 		 351 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  53.09 
 
 		 360 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  330  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  55.41 
 
 		 338 aa  331  1e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  330  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  53.42 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  55.08 
 
 		 327 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  59.65 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  53.07 
 
 		 342 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  55.95 
 
 		 336 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  329  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  53.23 
 
 		 344 aa  329  4e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  51.62 
 
 		 352 aa  328  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  53.7 
 
 		 350 aa  328  6e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  51.78 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  49.84 
 
 		 388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  53.18 
 
 		 356 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  50.96 
 
 		 352 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  50.49 
 
 		 350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1129  biotin synthase  54.43 
 
 		 342 aa  326  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  51.62 
 
 		 352 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  50.8 
 
 		 352 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  51.28 
 
 		 352 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  54.4 
 
 		 345 aa  325  5e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1475  biotin synthase  53.85 
 
 		 350 aa  325  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  50.64 
 
 		 352 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  51.62 
 
 		 352 aa  325  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  52.73 
 
 		 346 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  50.65 
 
 		 374 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  52.41 
 
 		 354 aa  323  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  53.35 
 
 		 341 aa  323  2e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  53.09 
 
 		 335 aa  323  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>