More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4292 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  100 
 
 		 326 aa  678    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  67.3 
 
 		 332 aa  471  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  66.03 
 
 		 330 aa  447  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  65.06 
 
 		 337 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  59.87 
 
 		 335 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  61.74 
 
 		 335 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  58.6 
 
 		 333 aa  413  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  58.68 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  59.42 
 
 		 375 aa  392  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  59.62 
 
 		 362 aa  390  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  55 
 
 		 437 aa  384  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  54.86 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  53.5 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  55.73 
 
 		 340 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  52.2 
 
 		 393 aa  357  9.999999999999999e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  55.97 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  55.35 
 
 		 347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  55.97 
 
 		 341 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  53.63 
 
 		 352 aa  355  3.9999999999999996e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  54.49 
 
 		 331 aa  355  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  54.46 
 
 		 374 aa  353  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  53.61 
 
 		 334 aa  353  2.9999999999999997e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  54.09 
 
 		 344 aa  352  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  53.48 
 
 		 320 aa  352  5e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  53.8 
 
 		 320 aa  352  7e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  54.81 
 
 		 324 aa  352  7e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  51.41 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  53.21 
 
 		 333 aa  349  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  53.05 
 
 		 328 aa  348  8e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  52.83 
 
 		 340 aa  347  1e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  51.59 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  53.16 
 
 		 360 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  52.8 
 
 		 346 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  52.85 
 
 		 362 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  50.96 
 
 		 315 aa  345  8e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  53.44 
 
 		 356 aa  345  8e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  52.12 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  52.12 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  52.85 
 
 		 359 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  50.62 
 
 		 338 aa  343  2e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  53.8 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  50.16 
 
 		 350 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  50.64 
 
 		 315 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  51.79 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  51.79 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  51.79 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  51.79 
 
 		 346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  4e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  53.67 
 
 		 369 aa  342  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  51.58 
 
 		 345 aa  342  5e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  52.05 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  51.94 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  51.94 
 
 		 346 aa  342  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  54.78 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  52.37 
 
 		 351 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  55.48 
 
 		 327 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  51.94 
 
 		 345 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  53.57 
 
 		 344 aa  339  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  54.14 
 
 		 345 aa  338  8e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  51.47 
 
 		 345 aa  338  9e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  51.28 
 
 		 350 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  51.58 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  51.42 
 
 		 341 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  54.05 
 
 		 361 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  51.47 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  51.47 
 
 		 345 aa  337  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  50.79 
 
 		 353 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  50.8 
 
 		 352 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0574  biotin synthase  54.26 
 
 		 328 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  54.81 
 
 		 332 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  53.72 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  50.79 
 
 		 342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  50.79 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  50.16 
 
 		 350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  51.61 
 
 		 364 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  51.58 
 
 		 346 aa  335  3.9999999999999995e-91  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1923  biotin synthase  54.26 
 
 		 328 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  51.27 
 
 		 345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  50.96 
 
 		 350 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  50.48 
 
 		 352 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  50.79 
 
 		 352 aa  335  7e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  50.16 
 
 		 356 aa  335  7e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  52.85 
 
 		 356 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  52.41 
 
 		 354 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  50.48 
 
 		 352 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  50.8 
 
 		 350 aa  334  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  51.94 
 
 		 345 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>