More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1433 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  100 
 
 		 324 aa  668    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1923  biotin synthase  92.26 
 
 		 328 aa  592  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0574  biotin synthase  91.95 
 
 		 328 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  69.58 
 
 		 350 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  67.08 
 
 		 345 aa  467  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  67.53 
 
 		 340 aa  456  1e-127  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  66.23 
 
 		 341 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  61.66 
 
 		 333 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  61.29 
 
 		 339 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  61.29 
 
 		 339 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  60.06 
 
 		 368 aa  409  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  60.76 
 
 		 345 aa  407  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  59.75 
 
 		 353 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  61.49 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  61.29 
 
 		 339 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  62.46 
 
 		 336 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  61.97 
 
 		 336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  61.29 
 
 		 322 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  62.3 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  58.6 
 
 		 352 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  61.97 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  61.29 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  60.65 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  58.92 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  60.33 
 
 		 336 aa  398  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  58.6 
 
 		 361 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  59.55 
 
 		 331 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  57.23 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  57.96 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  61.09 
 
 		 346 aa  394  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  59.28 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  61.09 
 
 		 328 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  57.47 
 
 		 315 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  60.66 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  62.15 
 
 		 336 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  60.9 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  61.54 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  59.28 
 
 		 362 aa  392  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  60.9 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  61.54 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  60.9 
 
 		 339 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  60.66 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  56.96 
 
 		 351 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  59.28 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  57.14 
 
 		 315 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  60.32 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  60.9 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  58.96 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  61.54 
 
 		 339 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  56.82 
 
 		 352 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  56.49 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  60.84 
 
 		 356 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  60.73 
 
 		 345 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  55.48 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  61.36 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  56.49 
 
 		 352 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  57.93 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  56.96 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  56.63 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  56.47 
 
 		 354 aa  381  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  56.45 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  56.49 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  55.48 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  54.72 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  57.19 
 
 		 335 aa  381  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  60.32 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  56.49 
 
 		 352 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  56.49 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  56.82 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  57.1 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  57.61 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  57.1 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  60.33 
 
 		 342 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  57.1 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  57.1 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  55.41 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  58.03 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  57.1 
 
 		 350 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  57.61 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  57.61 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  57.61 
 
 		 350 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  59.8 
 
 		 320 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  55.73 
 
 		 354 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  62.72 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  54.34 
 
 		 367 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  54.37 
 
 		 364 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  52.52 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  59.03 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  59.03 
 
 		 341 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  52.52 
 
 		 350 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  55.84 
 
 		 354 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  52.32 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  57.47 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  57.28 
 
 		 326 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  53.05 
 
 		 338 aa  373  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  55.34 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  55.88 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  58.45 
 
 		 349 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  60 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  52.6 
 
 		 351 aa  372  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>