More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0259 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  100 
 
 		 316 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  100 
 
 		 316 aa  652    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  67.66 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  66.78 
 
 		 345 aa  422  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  65.02 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  66.23 
 
 		 336 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  66.23 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  66.23 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  66.56 
 
 		 339 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  66.23 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  66.23 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  66.23 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  62.5 
 
 		 347 aa  411  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  65.89 
 
 		 339 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  64.67 
 
 		 351 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  65.45 
 
 		 337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  63.37 
 
 		 360 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  63.7 
 
 		 361 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  65.56 
 
 		 339 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  65.56 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  60.53 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  65.56 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  65.56 
 
 		 339 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  59.54 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  59.54 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  59.54 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  59.54 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  59.54 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  65.46 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  59.54 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  65.28 
 
 		 325 aa  394  1e-109  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  59.54 
 
 		 346 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  65.89 
 
 		 339 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  65.56 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  59.54 
 
 		 346 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  59.94 
 
 		 362 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  62.79 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  59.6 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  58.55 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1786  biotin synthase  62.99 
 
 		 330 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  60.53 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1167  biotin synthase  62.83 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.893176  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  58.55 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  59.21 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  60.66 
 
 		 324 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  58.22 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  58.88 
 
 		 345 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  59.21 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  59.21 
 
 		 345 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  62.63 
 
 		 342 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  63.25 
 
 		 345 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  58.22 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  58.22 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  59.21 
 
 		 346 aa  387  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  58.22 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  62.5 
 
 		 333 aa  387  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  58.55 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  59.28 
 
 		 351 aa  385  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  58.55 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  62 
 
 		 345 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  59.74 
 
 		 352 aa  387  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  64.65 
 
 		 345 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  60.94 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  61.06 
 
 		 344 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  61.79 
 
 		 359 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  61.28 
 
 		 346 aa  384  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  61.56 
 
 		 326 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  60.07 
 
 		 351 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  59.02 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  61.28 
 
 		 328 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  62.46 
 
 		 347 aa  381  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  56.27 
 
 		 315 aa  381  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  59.27 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  59.28 
 
 		 352 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  62.17 
 
 		 327 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  63.58 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  62.32 
 
 		 326 aa  383  1e-105  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  63.18 
 
 		 344 aa  382  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  60.74 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  59.26 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  59.6 
 
 		 345 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  58.75 
 
 		 336 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  58.55 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  58.17 
 
 		 352 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  57.43 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  58.63 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  56.27 
 
 		 315 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  57.98 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  56.39 
 
 		 338 aa  381  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  58.8 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1129  biotin synthase  61.76 
 
 		 342 aa  380  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  61.95 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  58.94 
 
 		 354 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  58.42 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  60.47 
 
 		 354 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  58.8 
 
 		 321 aa  379  1e-104  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  57.98 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0319  biotin synthase  61.09 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225916  normal  0.0136703 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  60.59 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  59.4 
 
 		 320 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>