More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_21296 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  100 
 
 		 437 aa  915    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  63.44 
 
 		 330 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  61.25 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  54.44 
 
 		 388 aa  399  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  57.05 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  59.05 
 
 		 338 aa  390  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  55 
 
 		 326 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  56.87 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  56.87 
 
 		 345 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  55.25 
 
 		 335 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  56.07 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  57.19 
 
 		 350 aa  378  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  57.1 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  53.98 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  56.78 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  55.76 
 
 		 364 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  55.97 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  56.47 
 
 		 352 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  57.51 
 
 		 320 aa  370  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  54.13 
 
 		 356 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  57.4 
 
 		 329 aa  369  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  63.82 
 
 		 311 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  56.87 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  55.84 
 
 		 352 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  56.47 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  54.66 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  56.47 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  54.43 
 
 		 335 aa  365  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  57.01 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  55.14 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  54.83 
 
 		 333 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  56.05 
 
 		 333 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  54.6 
 
 		 352 aa  365  1e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  55.79 
 
 		 356 aa  365  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  56.15 
 
 		 351 aa  363  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  56.96 
 
 		 338 aa  364  2e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  57.42 
 
 		 362 aa  364  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  53.11 
 
 		 342 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  56.77 
 
 		 360 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  54.29 
 
 		 340 aa  362  1e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  55.21 
 
 		 363 aa  361  1e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  56.73 
 
 		 345 aa  362  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  361  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  57.1 
 
 		 359 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  54.11 
 
 		 335 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  361  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  54.92 
 
 		 352 aa  360  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  56.41 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  55.35 
 
 		 351 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  55.49 
 
 		 352 aa  360  3e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  56.41 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  56.63 
 
 		 346 aa  360  4e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  54.49 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  54.01 
 
 		 340 aa  359  5e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  53.85 
 
 		 324 aa  359  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  55.13 
 
 		 315 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  52.41 
 
 		 332 aa  358  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  51.83 
 
 		 353 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  54.92 
 
 		 352 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  55.99 
 
 		 346 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  54.14 
 
 		 345 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  54.04 
 
 		 350 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  53.96 
 
 		 344 aa  356  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  55.66 
 
 		 361 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  55.66 
 
 		 346 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  55.66 
 
 		 346 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  55.66 
 
 		 346 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  52.8 
 
 		 350 aa  356  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  54.81 
 
 		 315 aa  355  5.999999999999999e-97  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  53.7 
 
 		 331 aa  355  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  55.66 
 
 		 346 aa  355  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  58.1 
 
 		 332 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  55.66 
 
 		 347 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  53.27 
 
 		 336 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  51.9 
 
 		 346 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  55.03 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  52.85 
 
 		 345 aa  354  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  54.75 
 
 		 334 aa  354  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  53.73 
 
 		 356 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  55.42 
 
 		 341 aa  352  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  55.42 
 
 		 341 aa  352  5.9999999999999994e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  53.16 
 
 		 374 aa  352  5.9999999999999994e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  52.55 
 
 		 345 aa  352  7e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  56.09 
 
 		 345 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  51.34 
 
 		 351 aa  352  1e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  53.7 
 
 		 336 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  53.7 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  53.7 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  54.04 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  53 
 
 		 320 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  55.77 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  53.18 
 
 		 342 aa  351  2e-95  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  53.7 
 
 		 339 aa  350  2e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  55.87 
 
 		 336 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  52.07 
 
 		 354 aa  350  3e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>