More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2168 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  100 
 
 		 335 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  66.57 
 
 		 337 aa  480  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  64.49 
 
 		 330 aa  454  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  65.73 
 
 		 362 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  67.52 
 
 		 332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  65.08 
 
 		 363 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  62.61 
 
 		 375 aa  442  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  61.3 
 
 		 335 aa  416  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  61.13 
 
 		 333 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  61.74 
 
 		 326 aa  412  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  55.25 
 
 		 437 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  57.14 
 
 		 350 aa  371  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  53.43 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  54.95 
 
 		 368 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  53.43 
 
 		 356 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  55.59 
 
 		 342 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  56.13 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  56.72 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  56.39 
 
 		 346 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  56.39 
 
 		 346 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  56.72 
 
 		 346 aa  360  3e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  54.34 
 
 		 350 aa  359  3e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  54.6 
 
 		 340 aa  360  3e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  56.39 
 
 		 346 aa  359  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  56.39 
 
 		 346 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  56.07 
 
 		 346 aa  358  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  56.07 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  56.07 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  56.07 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  56.07 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  56.07 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  56.07 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  56.07 
 
 		 346 aa  358  8e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  54.41 
 
 		 367 aa  358  9e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  52.35 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  55.74 
 
 		 346 aa  357  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  52.73 
 
 		 320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  54.05 
 
 		 345 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  54.14 
 
 		 353 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  57.32 
 
 		 356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  51.72 
 
 		 335 aa  355  5e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  54.22 
 
 		 364 aa  355  5.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  53.33 
 
 		 345 aa  355  8.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  55.99 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  56.21 
 
 		 346 aa  353  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  56.17 
 
 		 350 aa  353  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  55.02 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  51.07 
 
 		 338 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  54.69 
 
 		 345 aa  352  4e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  55.84 
 
 		 356 aa  352  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  52.63 
 
 		 345 aa  352  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  53.04 
 
 		 342 aa  352  7e-96  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  52.73 
 
 		 345 aa  352  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  53.04 
 
 		 352 aa  351  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  56.71 
 
 		 320 aa  351  8e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  52.4 
 
 		 352 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  53.63 
 
 		 344 aa  351  8.999999999999999e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  53.04 
 
 		 334 aa  351  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  53.18 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  54.69 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  54.69 
 
 		 345 aa  350  2e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  53.04 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  54.29 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  55.1 
 
 		 336 aa  349  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  53.53 
 
 		 331 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  53.57 
 
 		 351 aa  348  6e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  53.23 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  55.08 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  53.23 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  55.88 
 
 		 345 aa  347  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  53.23 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  55.45 
 
 		 346 aa  347  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  53.23 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  53.53 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  53.05 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  53.03 
 
 		 350 aa  345  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  55.84 
 
 		 354 aa  345  5e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  51.13 
 
 		 332 aa  345  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  53.85 
 
 		 345 aa  345  8.999999999999999e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  52.73 
 
 		 354 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  54.37 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  53.21 
 
 		 315 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  55.88 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  54.69 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  54.69 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  54.69 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  54.69 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  54.37 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  54.37 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  54.37 
 
 		 350 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  50.65 
 
 		 345 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  53.59 
 
 		 362 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  51.66 
 
 		 369 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  54.37 
 
 		 350 aa  342  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  53.59 
 
 		 360 aa  342  5e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  53.59 
 
 		 359 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1719  biotin synthase  53.94 
 
 		 350 aa  342  5e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0119643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  50 
 
 		 345 aa  342  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  52.63 
 
 		 314 aa  342  7e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  51.94 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>