More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_10931 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  100 
 
 
332 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  76.06 
 
 
335 aa  523  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  74.52 
 
 
345 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  74.52 
 
 
345 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  75 
 
 
331 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  73.42 
 
 
333 aa  486  1e-136  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  69.33 
 
 
335 aa  471  1e-132  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  69.01 
 
 
335 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  71.33 
 
 
314 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  70.44 
 
 
335 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  65.48 
 
 
320 aa  433  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  63.99 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  59.94 
 
 
341 aa  385  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  61.86 
 
 
335 aa  381  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  61.86 
 
 
335 aa  381  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  58.44 
 
 
339 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  58.44 
 
 
336 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  58.44 
 
 
322 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5411  biotin synthase  59.12 
 
 
332 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.706844  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  60.45 
 
 
337 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  59.02 
 
 
339 aa  378  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6069  biotin synthase  59.75 
 
 
333 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.498375  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  58.44 
 
 
339 aa  378  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  58.44 
 
 
339 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  59.02 
 
 
339 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  59.02 
 
 
336 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  58.1 
 
 
333 aa  374  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  55.31 
 
 
350 aa  371  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  58.5 
 
 
351 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  58.17 
 
 
360 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  58.71 
 
 
320 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  58.17 
 
 
361 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  55.73 
 
 
375 aa  363  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  56.27 
 
 
340 aa  362  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  54.43 
 
 
337 aa  362  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  56.77 
 
 
345 aa  360  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  53.72 
 
 
364 aa  359  3e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  53.04 
 
 
350 aa  359  5e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  55.52 
 
 
345 aa  357  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  55.66 
 
 
331 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  53.21 
 
 
356 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  56.17 
 
 
339 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  56.17 
 
 
339 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  56.17 
 
 
339 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  53.87 
 
 
330 aa  354  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  56.49 
 
 
339 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  56.17 
 
 
339 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  53.05 
 
 
350 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  55.42 
 
 
330 aa  352  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  54.81 
 
 
362 aa  352  7e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  54.29 
 
 
354 aa  351  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  55.34 
 
 
346 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  56.54 
 
 
340 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  54.29 
 
 
354 aa  350  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  55.84 
 
 
339 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  53.87 
 
 
368 aa  350  3e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  52.92 
 
 
362 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  54.49 
 
 
359 aa  349  3e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  53.72 
 
 
352 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  54.98 
 
 
334 aa  349  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  53.38 
 
 
367 aa  347  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  54.55 
 
 
346 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  53.55 
 
 
351 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  52.24 
 
 
338 aa  347  1e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  54.69 
 
 
346 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  54.69 
 
 
346 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  54.69 
 
 
346 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  54.49 
 
 
360 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  54.69 
 
 
346 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  54.69 
 
 
346 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  54.69 
 
 
346 aa  347  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  56.04 
 
 
320 aa  347  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  54.69 
 
 
346 aa  347  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  54.58 
 
 
346 aa  346  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  53.4 
 
 
352 aa  346  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  54.34 
 
 
354 aa  346  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  52.52 
 
 
374 aa  346  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  53.07 
 
 
352 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  53.87 
 
 
350 aa  345  5e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  54.25 
 
 
346 aa  345  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  52.88 
 
 
352 aa  345  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  51.13 
 
 
335 aa  345  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  52.56 
 
 
352 aa  345  6e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  53.07 
 
 
352 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  53.92 
 
 
346 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  53.92 
 
 
346 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  53.92 
 
 
346 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  52.56 
 
 
352 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  53.55 
 
 
352 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  51.94 
 
 
352 aa  343  2e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  53.18 
 
 
350 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  50.65 
 
 
363 aa  343  2.9999999999999997e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  53.57 
 
 
344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  54.64 
 
 
349 aa  342  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  53.27 
 
 
346 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  52.55 
 
 
350 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  52.55 
 
 
350 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  52.55 
 
 
437 aa  341  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  51.9 
 
 
332 aa  340  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  52.55 
 
 
350 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>