More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2132 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2132  biotin synthase  100 
 
 		 342 aa  706    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  82.46 
 
 		 353 aa  541  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  82.15 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  81.5 
 
 		 350 aa  521  1e-147  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  80.88 
 
 		 350 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0897  biotin synthase  68.71 
 
 		 337 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.615591 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  66.67 
 
 		 344 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  67.87 
 
 		 345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  65.61 
 
 		 349 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  66.24 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  64.86 
 
 		 351 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  65.19 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  63.84 
 
 		 339 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  64.33 
 
 		 360 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  64.15 
 
 		 339 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  63.84 
 
 		 336 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  63.84 
 
 		 339 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  63.84 
 
 		 339 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  63.32 
 
 		 360 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  66.67 
 
 		 359 aa  438  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  63.84 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  63.84 
 
 		 322 aa  437  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  63.64 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  63.84 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  69.9 
 
 		 345 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1786  biotin synthase  69.28 
 
 		 330 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.904329 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0150  biotin synthase  65.93 
 
 		 342 aa  428  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  61.46 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  66.34 
 
 		 345 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  59.24 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  59.24 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  59.55 
 
 		 350 aa  419  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  66.55 
 
 		 325 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  61.29 
 
 		 346 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  59.81 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  59.81 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  60.97 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  59.43 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  59.81 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  59.81 
 
 		 346 aa  412  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  60.97 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  62.89 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  59.81 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1129  biotin synthase  65.03 
 
 		 342 aa  413  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  60.12 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  59.81 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  58.26 
 
 		 350 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  62.3 
 
 		 335 aa  411  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  59.81 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  60.97 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  60.97 
 
 		 346 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  59.81 
 
 		 346 aa  411  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  60.32 
 
 		 333 aa  409  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  59.09 
 
 		 352 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  62.5 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  60.84 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  62.5 
 
 		 341 aa  410  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  60 
 
 		 368 aa  411  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  63.17 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  63.64 
 
 		 339 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  60.84 
 
 		 345 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  62.46 
 
 		 344 aa  409  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  57.41 
 
 		 374 aa  409  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  63.64 
 
 		 339 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  60.52 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  63.64 
 
 		 339 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  60.26 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  60.52 
 
 		 345 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  60.65 
 
 		 345 aa  404  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  62.75 
 
 		 340 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  60 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  59.81 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1010  biotin synthase  58.46 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  62.54 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  59.74 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  59.22 
 
 		 345 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  59.55 
 
 		 345 aa  402  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  56.7 
 
 		 352 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  62.75 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  56.87 
 
 		 351 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  57.01 
 
 		 350 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0319  biotin synthase  64.92 
 
 		 317 aa  400  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225916  normal  0.0136703 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  60.37 
 
 		 326 aa  400  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  58.12 
 
 		 354 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  55.35 
 
 		 364 aa  397  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  57.61 
 
 		 367 aa  397  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  58.12 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  57.49 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  57.79 
 
 		 354 aa  394  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  63.34 
 
 		 336 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  56.43 
 
 		 352 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  56.43 
 
 		 352 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  56.11 
 
 		 352 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  58.12 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  58.12 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  61.17 
 
 		 337 aa  394  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  56.07 
 
 		 352 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  58.12 
 
 		 350 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  57.01 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  57.47 
 
 		 350 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>