91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2633 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  100 
 
 
389 aa  788    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  78.04 
 
 
393 aa  614  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  70.67 
 
 
372 aa  546  1e-154  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  73.71 
 
 
368 aa  523  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  65.45 
 
 
387 aa  500  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  46.2 
 
 
329 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  50 
 
 
327 aa  277  3e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46 
 
 
565 aa  276  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  44.64 
 
 
800 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.82 
 
 
863 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  43.49 
 
 
325 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  43.65 
 
 
330 aa  257  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  41.99 
 
 
392 aa  256  6e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  44.97 
 
 
792 aa  255  8e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 
331 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  44.23 
 
 
838 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  43.52 
 
 
321 aa  251  2e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  41.4 
 
 
380 aa  248  9e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.08 
 
 
416 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  40.46 
 
 
856 aa  247  3e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  41.1 
 
 
857 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  41.62 
 
 
859 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.94 
 
 
872 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  41.62 
 
 
859 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  41.33 
 
 
859 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  40.46 
 
 
859 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  43.93 
 
 
852 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.36 
 
 
836 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.51 
 
 
419 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.77 
 
 
860 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.76 
 
 
875 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  40.46 
 
 
859 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  45.51 
 
 
826 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 
390 aa  239  4e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  39.12 
 
 
352 aa  239  9e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  45.33 
 
 
326 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  42.15 
 
 
881 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  41.62 
 
 
811 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  41.13 
 
 
841 aa  237  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  39.43 
 
 
352 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  38.87 
 
 
380 aa  236  7e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  44.59 
 
 
386 aa  235  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  38.54 
 
 
842 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.82 
 
 
871 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  41.06 
 
 
867 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  42.26 
 
 
820 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 
859 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  36.65 
 
 
351 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  38.61 
 
 
352 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  42.98 
 
 
884 aa  226  7e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  43.03 
 
 
430 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  43.17 
 
 
779 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  42.61 
 
 
944 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  39.3 
 
 
841 aa  216  5e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.77 
 
 
899 aa  211  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  38.76 
 
 
757 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  36.3 
 
 
319 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.12 
 
 
741 aa  182  7e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  39.6 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.37 
 
 
737 aa  179  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  38.31 
 
 
340 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.25 
 
 
737 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  34.66 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  36.88 
 
 
318 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  38.61 
 
 
336 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  37.46 
 
 
307 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.13 
 
 
325 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 
404 aa  61.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 
385 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
396 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.38 
 
 
364 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  25.48 
 
 
395 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 
362 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 
367 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  23 
 
 
356 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 
377 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  24.85 
 
 
384 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
515 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  22.91 
 
 
376 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  24.56 
 
 
384 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  23.53 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  21 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  23.8 
 
 
361 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 
362 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 
368 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 
386 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  24.06 
 
 
365 aa  43.1  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  22.19 
 
 
371 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>