190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0976 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 327 aa  674    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  65.84 
 
 		 331 aa  441  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  62.58 
 
 		 329 aa  435  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  61.06 
 
 		 565 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  59.43 
 
 		 321 aa  393  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  54.09 
 
 		 330 aa  352  5e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  53.16 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  51.13 
 
 		 387 aa  300  3e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  50.66 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  48.56 
 
 		 326 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  45.54 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  50 
 
 		 389 aa  277  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  48.54 
 
 		 372 aa  273  3e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  48.52 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  46.36 
 
 		 820 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  42.51 
 
 		 392 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  47.32 
 
 		 826 aa  263  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  46.3 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 800 aa  263  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  47.44 
 
 		 838 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.01 
 
 		 867 aa  259  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  45.35 
 
 		 860 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  45.05 
 
 		 836 aa  259  6e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  44.34 
 
 		 792 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  43.98 
 
 		 857 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  45.66 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.77 
 
 		 419 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  44.28 
 
 		 852 aa  255  9e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  45.09 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  44.69 
 
 		 352 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  44.69 
 
 		 352 aa  251  8.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.92 
 
 		 416 aa  250  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  43.54 
 
 		 881 aa  249  5e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  42.39 
 
 		 859 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  42.39 
 
 		 859 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.25 
 
 		 863 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  45.78 
 
 		 884 aa  248  1e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  42.39 
 
 		 859 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  42.09 
 
 		 859 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.69 
 
 		 859 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  42.99 
 
 		 856 aa  247  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  42.11 
 
 		 871 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.17 
 
 		 859 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.72 
 
 		 875 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.14 
 
 		 872 aa  238  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  43.24 
 
 		 779 aa  237  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  41.42 
 
 		 842 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  44.41 
 
 		 386 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  42.14 
 
 		 811 aa  232  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.02 
 
 		 944 aa  231  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  39.23 
 
 		 841 aa  229  6e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.95 
 
 		 741 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  42.24 
 
 		 841 aa  225  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  44.11 
 
 		 899 aa  225  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  40.76 
 
 		 430 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.45 
 
 		 737 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.04 
 
 		 737 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  42.95 
 
 		 757 aa  209  6e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  39.88 
 
 		 318 aa  188  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  40.19 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  35.37 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  39.56 
 
 		 318 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  39.31 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  37.58 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  39.3 
 
 		 325 aa  168  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  37.03 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  25 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  27.03 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  26.84 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  25.81 
 
 		 360 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  22.32 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.34 
 
 		 364 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  25.22 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  24.23 
 
 		 346 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  25.23 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  23.77 
 
 		 345 aa  53.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  25.23 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  23.77 
 
 		 320 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 347 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  24.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  24.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  24.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  24.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  24.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  24.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  24.23 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  23.38 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1010  biotin synthase  22.12 
 
 		 331 aa  52  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  23.32 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  25.68 
 
 		 311 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  24.56 
 
 		 364 aa  52  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  23.48 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  23.37 
 
 		 356 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.41 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  29.5 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  24.23 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  21.83 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>