263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1304 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  100 
 
 
356 aa  739    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  67.04 
 
 
384 aa  520  1e-146  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  58.76 
 
 
376 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  54.52 
 
 
356 aa  431  1e-120  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  44.16 
 
 
358 aa  322  5e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  43.18 
 
 
359 aa  294  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  41.71 
 
 
370 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  41.71 
 
 
359 aa  290  4e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  41.55 
 
 
359 aa  288  7e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 
419 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  41 
 
 
429 aa  280  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  42.73 
 
 
800 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  40.61 
 
 
362 aa  271  1e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  38.92 
 
 
362 aa  270  4e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  42.02 
 
 
435 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  40.46 
 
 
859 aa  266  5e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  42.86 
 
 
361 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  40.3 
 
 
826 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 
418 aa  262  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  37.22 
 
 
366 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  39.7 
 
 
792 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  39.26 
 
 
859 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  38.72 
 
 
367 aa  258  1e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 
364 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  39.39 
 
 
820 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 
362 aa  256  5e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  38.96 
 
 
859 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  38.37 
 
 
899 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  37.05 
 
 
859 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  37.05 
 
 
859 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  38.74 
 
 
867 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  37.05 
 
 
859 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  37.71 
 
 
842 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 
757 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  40.82 
 
 
365 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
362 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  39.39 
 
 
779 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.69 
 
 
453 aa  250  2e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  36.9 
 
 
856 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  36.19 
 
 
361 aa  248  8e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  37.77 
 
 
368 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  39.02 
 
 
841 aa  248  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  37.57 
 
 
871 aa  247  2e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 
367 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.01 
 
 
863 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  38.72 
 
 
836 aa  246  4e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  38.11 
 
 
860 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  37.43 
 
 
367 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  38.41 
 
 
944 aa  243  5e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.31 
 
 
382 aa  242  9e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  36.03 
 
 
367 aa  242  9e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.53 
 
 
872 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  35.59 
 
 
367 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  37.88 
 
 
362 aa  239  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 
358 aa  239  5e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  39.63 
 
 
881 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  37.35 
 
 
841 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.71 
 
 
875 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.27 
 
 
359 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  36.06 
 
 
368 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  35.21 
 
 
388 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  36.52 
 
 
381 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  35.95 
 
 
852 aa  235  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.8 
 
 
741 aa  234  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  35.06 
 
 
388 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.8 
 
 
737 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  36.41 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 
387 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  36.81 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.51 
 
 
737 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  37.35 
 
 
857 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  34.35 
 
 
376 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  36.31 
 
 
384 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 
388 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  36.97 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  36.01 
 
 
384 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  38.41 
 
 
838 aa  232  7.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  35.48 
 
 
391 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  38.11 
 
 
884 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  36.77 
 
 
355 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  35.23 
 
 
365 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  37.11 
 
 
376 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 
391 aa  229  5e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  36.77 
 
 
373 aa  229  6e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  35.07 
 
 
360 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 
361 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  35.76 
 
 
364 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 
358 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.14 
 
 
349 aa  226  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  35.88 
 
 
398 aa  225  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 
358 aa  225  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  35.84 
 
 
345 aa  225  9e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  38.18 
 
 
358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  35.16 
 
 
358 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  34.67 
 
 
354 aa  220  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  34.25 
 
 
372 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 
359 aa  219  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  33.15 
 
 
375 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
374 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 
359 aa  218  2e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>