115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0642 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  100 
 
 
393 aa  793    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  78.04 
 
 
389 aa  614  1e-175  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  66.84 
 
 
372 aa  534  1e-151  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  71.85 
 
 
368 aa  499  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  63.66 
 
 
387 aa  483  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  48.34 
 
 
565 aa  285  8e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  46.2 
 
 
329 aa  280  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  48.52 
 
 
327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  47.51 
 
 
330 aa  264  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  47.84 
 
 
321 aa  260  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  46.36 
 
 
800 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  47.94 
 
 
792 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.63 
 
 
863 aa  255  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  44.9 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  47.02 
 
 
331 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  40.65 
 
 
390 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  45.03 
 
 
859 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  45.03 
 
 
859 aa  246  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  40.96 
 
 
392 aa  245  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  44.55 
 
 
841 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  41.91 
 
 
859 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  44.72 
 
 
859 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.6 
 
 
836 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  48.16 
 
 
326 aa  243  3e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  40.69 
 
 
352 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.73 
 
 
860 aa  243  3e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.07 
 
 
416 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  41.4 
 
 
352 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  43.79 
 
 
859 aa  242  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  41.85 
 
 
857 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45 
 
 
419 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  42.94 
 
 
838 aa  239  5e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  46.03 
 
 
852 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  41.69 
 
 
856 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  43.23 
 
 
380 aa  236  5.0000000000000005e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  38.82 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  42.54 
 
 
881 aa  235  9e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  39.48 
 
 
351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  43.59 
 
 
386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  41.75 
 
 
380 aa  234  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  45.45 
 
 
779 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.11 
 
 
872 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.21 
 
 
875 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  42.81 
 
 
867 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  40.97 
 
 
820 aa  229  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  41.19 
 
 
842 aa  229  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.72 
 
 
871 aa  229  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  42.72 
 
 
811 aa  227  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  43.17 
 
 
430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.68 
 
 
859 aa  225  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  42.62 
 
 
884 aa  223  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  43.65 
 
 
826 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.38 
 
 
841 aa  213  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  43.44 
 
 
944 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  41.9 
 
 
899 aa  209  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 
757 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35 
 
 
741 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  35.13 
 
 
319 aa  182  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  37.78 
 
 
336 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.01 
 
 
737 aa  173  5.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  36.07 
 
 
318 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  36.07 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  37.03 
 
 
321 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.69 
 
 
737 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  36.39 
 
 
340 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  34.42 
 
 
307 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  35.19 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  24.62 
 
 
356 aa  59.7  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
362 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 
385 aa  57  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  24.9 
 
 
380 aa  53.9  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
377 aa  53.9  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  26 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 
404 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 
362 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 
367 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  23.97 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
347 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
358 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  23.21 
 
 
356 aa  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  22.78 
 
 
348 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  24.78 
 
 
376 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 
394 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  27.21 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 
362 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  23.81 
 
 
384 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  21.43 
 
 
370 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 
368 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  24.46 
 
 
366 aa  47.4  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  23.51 
 
 
384 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  23.02 
 
 
364 aa  46.6  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  24.08 
 
 
355 aa  46.6  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  24.73 
 
 
361 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  30.77 
 
 
375 aa  45.8  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  21.35 
 
 
626 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>