More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1125 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  100 
 
 
341 aa  696    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  94.13 
 
 
341 aa  664    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  92.38 
 
 
341 aa  657    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  78.82 
 
 
341 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  72.81 
 
 
344 aa  503  1e-141  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  51.91 
 
 
349 aa  355  5e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  27.53 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  26.69 
 
 
354 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  28.14 
 
 
343 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  28.04 
 
 
351 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  28.3 
 
 
328 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  27.92 
 
 
328 aa  98.6  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 
365 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  29.41 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.95 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 
380 aa  92  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  26.46 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  28.52 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  30.72 
 
 
325 aa  90.1  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  26.94 
 
 
333 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  28.15 
 
 
347 aa  89.4  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
346 aa  89  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 
370 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  22.29 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  27.65 
 
 
349 aa  87.4  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  24.05 
 
 
311 aa  86.7  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  24.68 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  28.52 
 
 
338 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  24.12 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  21.66 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  31.28 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  26.65 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  26.8 
 
 
341 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  22.06 
 
 
368 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  27.76 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  27.21 
 
 
340 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  27.49 
 
 
326 aa  82  0.00000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  26.78 
 
 
322 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  29.12 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.12 
 
 
330 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  24.57 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  26.42 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  26.32 
 
 
357 aa  80.5  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 
360 aa  79.7  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  25.94 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  26.64 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  25.77 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  25 
 
 
360 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1204  hypothetical protein  24.38 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  27.52 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  30.57 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  30.57 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  24.32 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  25.74 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  25.16 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  26.59 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  26.52 
 
 
375 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  25.74 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  26.59 
 
 
321 aa  77.4  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  28.57 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  25.27 
 
 
335 aa  77  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  23.31 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  27.9 
 
 
320 aa  77  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  26.2 
 
 
348 aa  76.6  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  26.42 
 
 
334 aa  76.6  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  24.34 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  25.95 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  25.81 
 
 
337 aa  76.3  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  23.21 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  25.95 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  23.75 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  26.81 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  26.87 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  25.42 
 
 
333 aa  74.3  0.000000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  27.74 
 
 
345 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  23.19 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  23.72 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  24.92 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  25.47 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  25.47 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  25.47 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  25.47 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  24.49 
 
 
329 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  25.47 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  25.4 
 
 
331 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  24.91 
 
 
337 aa  72.4  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  27.59 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  22.39 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  25.47 
 
 
332 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  28.64 
 
 
331 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  24.49 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  25.47 
 
 
332 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  25.6 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  25.08 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  25.83 
 
 
358 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  24.92 
 
 
353 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  29.45 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>