124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0911 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  100 
 
 
380 aa  769    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  67.78 
 
 
352 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  66.76 
 
 
352 aa  503  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  67.23 
 
 
352 aa  501  1e-140  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  65.82 
 
 
351 aa  499  1e-140  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  43.5 
 
 
800 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  45.09 
 
 
392 aa  300  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  48.42 
 
 
330 aa  301  2e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.87 
 
 
836 aa  299  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  49.68 
 
 
565 aa  298  1e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  43.43 
 
 
860 aa  296  5e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  47.95 
 
 
325 aa  295  1e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  44.65 
 
 
881 aa  291  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  47 
 
 
331 aa  291  2e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  42.38 
 
 
838 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  43.47 
 
 
792 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  47.12 
 
 
321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  38.74 
 
 
867 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  46.79 
 
 
329 aa  285  8e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  40.6 
 
 
859 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  43.53 
 
 
842 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  41.69 
 
 
856 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  41.13 
 
 
859 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  41.16 
 
 
380 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.83 
 
 
863 aa  280  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  39.09 
 
 
820 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  40.95 
 
 
859 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  40.95 
 
 
859 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  45.26 
 
 
884 aa  279  4e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  40.95 
 
 
859 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  42.51 
 
 
857 aa  279  5e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.74 
 
 
419 aa  279  6e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  45.54 
 
 
327 aa  278  1e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.69 
 
 
859 aa  277  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  42.38 
 
 
779 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  42.45 
 
 
826 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  38.1 
 
 
871 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.27 
 
 
875 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.66 
 
 
872 aa  273  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  38.11 
 
 
852 aa  272  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  43.27 
 
 
386 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  41.41 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  41.9 
 
 
841 aa  263  3e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.86 
 
 
416 aa  263  4e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  39.69 
 
 
430 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  38.76 
 
 
811 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  39.55 
 
 
841 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  39.26 
 
 
944 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  39.27 
 
 
899 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  42.32 
 
 
326 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  39.17 
 
 
368 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  39.68 
 
 
387 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.51 
 
 
389 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.75 
 
 
393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  38.51 
 
 
372 aa  230  3e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.2 
 
 
741 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.11 
 
 
737 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.47 
 
 
737 aa  195  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 
757 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  37.15 
 
 
340 aa  182  9.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  38.65 
 
 
318 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  38.65 
 
 
318 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  34.38 
 
 
336 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  38.22 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37 
 
 
325 aa  171  2e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  38.54 
 
 
321 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  36.79 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 
362 aa  64.7  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  23.15 
 
 
361 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  25.53 
 
 
380 aa  63.2  0.000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 
353 aa  63.2  0.000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  20.85 
 
 
355 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  24.07 
 
 
343 aa  60.1  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  25.31 
 
 
349 aa  59.7  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  25.31 
 
 
359 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  24.86 
 
 
344 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  19.92 
 
 
365 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  24.28 
 
 
351 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  25.76 
 
 
341 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  27.27 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  23.49 
 
 
376 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  24.05 
 
 
370 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  21.3 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  24.69 
 
 
362 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  25.98 
 
 
356 aa  53.9  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  21.1 
 
 
362 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 
404 aa  53.5  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.24 
 
 
341 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  23.82 
 
 
419 aa  53.1  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  24.08 
 
 
352 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  30.16 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  25.1 
 
 
347 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  24.76 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  26.06 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  22.72 
 
 
346 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 
365 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>