183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0221 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 326 aa  655    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  55.42 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  53.11 
 
 		 325 aa  348  7e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  52.96 
 
 		 565 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  51.27 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  48.72 
 
 		 329 aa  302  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  49.52 
 
 		 327 aa  295  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  47.3 
 
 		 321 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  48.84 
 
 		 368 aa  271  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  44.55 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  46.25 
 
 		 352 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  45.62 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  43.89 
 
 		 380 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  45 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  48.83 
 
 		 393 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.3 
 
 		 419 aa  258  8e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  45.05 
 
 		 387 aa  253  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  43.27 
 
 		 800 aa  249  4e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  43.49 
 
 		 372 aa  249  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  45.66 
 
 		 380 aa  246  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  45.13 
 
 		 386 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  43.64 
 
 		 860 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  43.62 
 
 		 881 aa  246  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.5 
 
 		 836 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  42.99 
 
 		 838 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  44.97 
 
 		 792 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  40.61 
 
 		 392 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  40.95 
 
 		 867 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  42.9 
 
 		 820 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 		 859 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  41.25 
 
 		 779 aa  235  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  40.78 
 
 		 859 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  43.81 
 
 		 852 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  40.78 
 
 		 859 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  40.78 
 
 		 859 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.5 
 
 		 871 aa  232  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.79 
 
 		 416 aa  232  5e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  39.2 
 
 		 859 aa  231  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.83 
 
 		 875 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.36 
 
 		 863 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  41.12 
 
 		 856 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  42.42 
 
 		 884 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  40.12 
 
 		 859 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  40.72 
 
 		 826 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  41.34 
 
 		 841 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.3 
 
 		 872 aa  222  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  41.52 
 
 		 857 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  40.35 
 
 		 842 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  46.15 
 
 		 336 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  40.88 
 
 		 430 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  39.59 
 
 		 841 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 		 757 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  42.52 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  39.35 
 
 		 811 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  41.8 
 
 		 318 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.14 
 
 		 741 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.7 
 
 		 737 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  39.94 
 
 		 340 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  41.48 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  43.14 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  40.84 
 
 		 944 aa  200  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  41.44 
 
 		 899 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.12 
 
 		 737 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  40.94 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.73 
 
 		 325 aa  188  9e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  28.93 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 365 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 364 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  25.79 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  26.09 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  25.23 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  24.24 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  26.7 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 358 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  25.93 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  26.42 
 
 		 360 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 367 aa  52.8  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  27.73 
 
 		 350 aa  52.8  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  26.98 
 
 		 353 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  25.54 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  24.89 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  25.72 
 
 		 453 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  28.48 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  24.88 
 
 		 333 aa  51.6  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  25.69 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  27.88 
 
 		 341 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  23.47 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  28.24 
 
 		 332 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  28.18 
 
 		 368 aa  50.4  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  28.5 
 
 		 328 aa  49.7  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  21.62 
 
 		 368 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 364 aa  49.7  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  28.5 
 
 		 346 aa  49.7  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  23.36 
 
 		 335 aa  49.7  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  25.51 
 
 		 356 aa  49.7  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  27.23 
 
 		 350 aa  49.7  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>