227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0441 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
361 aa  740    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  89.11 
 
 
360 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  79.94 
 
 
360 aa  594  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  74.09 
 
 
358 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  74.09 
 
 
358 aa  551  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  62.29 
 
 
359 aa  475  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  63.97 
 
 
359 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  60.39 
 
 
362 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  54.8 
 
 
367 aa  422  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  56.62 
 
 
368 aa  411  1e-114  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  54.65 
 
 
367 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  56.02 
 
 
373 aa  395  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  53.07 
 
 
373 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  53.06 
 
 
368 aa  388  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  52.92 
 
 
387 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  51.25 
 
 
388 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  51.25 
 
 
388 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  51.25 
 
 
388 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  50.14 
 
 
367 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  49.44 
 
 
359 aa  372  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  50.14 
 
 
386 aa  358  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  50.84 
 
 
372 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  49.28 
 
 
367 aa  354  1e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  49.44 
 
 
391 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  49.44 
 
 
371 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  50.14 
 
 
373 aa  350  2e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  49.57 
 
 
360 aa  349  4e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  48.29 
 
 
387 aa  343  4e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  47.78 
 
 
376 aa  341  1e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  48.22 
 
 
380 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  46.24 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  47.19 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  49.16 
 
 
384 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  44.6 
 
 
350 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  48.04 
 
 
382 aa  325  6e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 
386 aa  322  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  47.77 
 
 
392 aa  322  6e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  45.58 
 
 
353 aa  322  9.000000000000001e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 
393 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  43.56 
 
 
396 aa  318  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  43.84 
 
 
390 aa  312  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  42.74 
 
 
353 aa  312  4.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  44.38 
 
 
389 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  42.3 
 
 
354 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  44.54 
 
 
353 aa  309  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  42.58 
 
 
354 aa  308  5.9999999999999995e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  42.3 
 
 
360 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  42.3 
 
 
354 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  44.99 
 
 
358 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  41.74 
 
 
354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  43.84 
 
 
389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  42.11 
 
 
397 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  44.38 
 
 
354 aa  299  5e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  43.37 
 
 
357 aa  289  6e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  42.82 
 
 
357 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  41.9 
 
 
355 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  41.24 
 
 
355 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 
360 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  41.94 
 
 
364 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 
365 aa  280  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  45.85 
 
 
356 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  42.29 
 
 
371 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  41.53 
 
 
362 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  39.73 
 
 
356 aa  273  3e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  42.7 
 
 
360 aa  272  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  40.34 
 
 
356 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  42.05 
 
 
354 aa  269  5e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 
375 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  38.83 
 
 
386 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 
419 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  38.48 
 
 
366 aa  266  4e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 
367 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  42.42 
 
 
380 aa  265  7e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  41.34 
 
 
355 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  40.51 
 
 
395 aa  264  2e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  39.72 
 
 
365 aa  263  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  40.22 
 
 
353 aa  263  4e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  38.27 
 
 
361 aa  262  6e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  38.86 
 
 
348 aa  262  6e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 
358 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 
381 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  38.75 
 
 
362 aa  261  1e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  39.67 
 
 
385 aa  260  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  39.57 
 
 
404 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  41.5 
 
 
354 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  39.19 
 
 
359 aa  259  6e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.66 
 
 
384 aa  257  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 
355 aa  257  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  38.4 
 
 
396 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  37.05 
 
 
362 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  37.46 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  38.75 
 
 
363 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  39.19 
 
 
350 aa  253  3e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  38.7 
 
 
376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 
352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  37.18 
 
 
370 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  37.47 
 
 
394 aa  252  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  40.7 
 
 
418 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  40.75 
 
 
357 aa  249  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  40.75 
 
 
353 aa  249  5e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>