93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3695 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 318 aa  650    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  99.37 
 
 		 318 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  70.38 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  71.9 
 
 		 307 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  70.68 
 
 		 325 aa  432  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  63.9 
 
 		 319 aa  430  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  65.08 
 
 		 321 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  60 
 
 		 336 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  41.09 
 
 		 565 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  42.64 
 
 		 329 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  41.98 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  38.53 
 
 		 330 aa  193  4e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  41.48 
 
 		 326 aa  188  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  39.13 
 
 		 419 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  36.7 
 
 		 390 aa  185  9e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  38.74 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  38.24 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  38.15 
 
 		 351 aa  179  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  33.74 
 
 		 387 aa  178  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  38.65 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 		 826 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  34.66 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  35.15 
 
 		 392 aa  173  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  35.78 
 
 		 372 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  36.07 
 
 		 393 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.39 
 
 		 741 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  36.47 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  35.87 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  36.2 
 
 		 352 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 881 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  33.03 
 
 		 859 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  33.03 
 
 		 859 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  33.94 
 
 		 856 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  33.03 
 
 		 859 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  34.46 
 
 		 820 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  35.35 
 
 		 838 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  33.13 
 
 		 859 aa  159  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  34.25 
 
 		 792 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  36.2 
 
 		 860 aa  158  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  33.13 
 
 		 859 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  34.23 
 
 		 416 aa  156  4e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  35.28 
 
 		 836 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  34.44 
 
 		 841 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  35.37 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  34.62 
 
 		 842 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  35.58 
 
 		 386 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 		 800 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  31.82 
 
 		 737 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.39 
 
 		 737 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  36.12 
 
 		 884 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  35.03 
 
 		 852 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.94 
 
 		 863 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  35.58 
 
 		 757 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  34.02 
 
 		 871 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  33.33 
 
 		 867 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  33.23 
 
 		 841 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  34.53 
 
 		 779 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  34.45 
 
 		 944 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  34.36 
 
 		 857 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  33.94 
 
 		 859 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.03 
 
 		 875 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  35.19 
 
 		 899 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  33.24 
 
 		 811 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.94 
 
 		 872 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  31.53 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.1 
 
 		 458 aa  54.3  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.71 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.35 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.3 
 
 		 377 aa  49.3  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.64 
 
 		 386 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  26.06 
 
 		 367 aa  47  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  23.02 
 
 		 384 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  23.96 
 
 		 384 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.67 
 
 		 385 aa  46.6  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.61 
 
 		 471 aa  46.2  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.75 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.13 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.75 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.59 
 
 		 469 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 358 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.27 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.2 
 
 		 473 aa  43.9  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.21 
 
 		 471 aa  43.9  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.5 
 
 		 487 aa  43.9  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.43 
 
 		 465 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.77 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  23.95 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.54 
 
 		 369 aa  42.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.13 
 
 		 458 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 		 364 aa  42.7  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1167  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 261 aa  42.4  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000379498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>