225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3415 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 325 aa  662    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  64.81 
 
 		 330 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  55.66 
 
 		 565 aa  375  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  54.43 
 
 		 329 aa  354  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  54.57 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  53.16 
 
 		 327 aa  335  7e-91  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  53.11 
 
 		 326 aa  332  4e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  50.63 
 
 		 321 aa  325  9e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  49.23 
 
 		 352 aa  295  7e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  47.95 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  49.21 
 
 		 351 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  45.21 
 
 		 392 aa  291  1e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  48.58 
 
 		 352 aa  286  2e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  47.63 
 
 		 352 aa  285  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  44.81 
 
 		 800 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  46.6 
 
 		 380 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  44.66 
 
 		 386 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  43.48 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.2 
 
 		 836 aa  267  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.9 
 
 		 860 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  45.93 
 
 		 826 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  43.15 
 
 		 859 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  43.15 
 
 		 859 aa  266  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  43.15 
 
 		 859 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  42.57 
 
 		 859 aa  265  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.03 
 
 		 419 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  40.42 
 
 		 820 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.43 
 
 		 863 aa  263  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 		 881 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  41.39 
 
 		 867 aa  262  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.56 
 
 		 859 aa  261  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  42.77 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  44.04 
 
 		 387 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  42.94 
 
 		 811 aa  259  4e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  41.96 
 
 		 856 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  41.99 
 
 		 857 aa  258  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  40.18 
 
 		 859 aa  258  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.49 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  44.38 
 
 		 841 aa  257  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  42.47 
 
 		 852 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  41.95 
 
 		 842 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  41.3 
 
 		 792 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  43.5 
 
 		 884 aa  255  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  40 
 
 		 838 aa  255  7e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.9 
 
 		 393 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.06 
 
 		 875 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.83 
 
 		 416 aa  252  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  38.11 
 
 		 871 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  42.43 
 
 		 779 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 		 430 aa  246  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  40.35 
 
 		 841 aa  243  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  41.52 
 
 		 757 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  41.74 
 
 		 899 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.35 
 
 		 872 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  41.44 
 
 		 944 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.69 
 
 		 741 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  41.03 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  42.35 
 
 		 340 aa  198  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  42.15 
 
 		 318 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  41.98 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.65 
 
 		 737 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.9 
 
 		 737 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  39.94 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  40.32 
 
 		 319 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  37.86 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  39.12 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  28 
 
 		 368 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  26.97 
 
 		 349 aa  70.5  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 364 aa  67  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  26.43 
 
 		 330 aa  65.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  24.45 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  29.96 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  29.41 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  28.33 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0547155 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  25.52 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  24.07 
 
 		 351 aa  59.3  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  28.05 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  24.66 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  28.69 
 
 		 341 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  25 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  24.68 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  23.97 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  25.73 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 368 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  25.24 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 358 aa  56.2  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  28.45 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  25.45 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  23.05 
 
 		 356 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  31.46 
 
 		 335 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  25.11 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  25.5 
 
 		 373 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 358 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  24.21 
 
 		 362 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  23.53 
 
 		 366 aa  52.4  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>