More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1738 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  100 
 
 		 349 aa  719    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  52.23 
 
 		 341 aa  361  9e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  51.59 
 
 		 341 aa  358  8e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  51.91 
 
 		 341 aa  355  5e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  53.82 
 
 		 344 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  50.47 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  25.97 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 349 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  25.43 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  28.36 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 365 aa  77  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  24.8 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  23.32 
 
 		 350 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  24.01 
 
 		 346 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  28.93 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  26.88 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  22.86 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  25.24 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  24.34 
 
 		 347 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  26.71 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  26.97 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 800 aa  69.3  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  23.33 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  25.18 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  27.69 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  24.01 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  27.09 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  26.94 
 
 		 392 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 826 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  25.93 
 
 		 341 aa  67  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  26.65 
 
 		 867 aa  67.4  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 881 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  25.67 
 
 		 324 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1204  hypothetical protein  25.27 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  24.46 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  24.46 
 
 		 316 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  29.46 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  21.17 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  29.46 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  23.9 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  26.78 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  29.46 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  28.97 
 
 		 884 aa  63.9  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  23.73 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  27.23 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  23.71 
 
 		 348 aa  63.2  0.000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  25.5 
 
 		 364 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  23.72 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  28.78 
 
 		 565 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  26.67 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  29 
 
 		 841 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  26.22 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1014  hypothetical protein  24.63 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  24.45 
 
 		 311 aa  60.8  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  26.99 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  25.73 
 
 		 326 aa  60.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  25.35 
 
 		 779 aa  60.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  25.31 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  23.51 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  20.81 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  27.33 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  22.65 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  26.25 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  22.87 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  27.91 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1667  hypothetical protein  24.63 
 
 		 350 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  22.67 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  20.9 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  23.48 
 
 		 860 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  23.49 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  23.93 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  26.78 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  25.23 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  20.37 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  31.15 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  26.21 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  26.21 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0932  hypothetical protein  24.6 
 
 		 350 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  22.91 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  25.83 
 
 		 852 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  20.39 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  28.57 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  25.36 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  25.31 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  22.73 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  24.06 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  22.89 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  25 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  21.83 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  23.71 
 
 		 836 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  24.53 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  22.76 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  28.3 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  25 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  20.49 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  26.17 
 
 		 341 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>