More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30955 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  100 
 
 		 361 aa  753    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0547155 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  55.03 
 
 		 393 aa  433  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  55.59 
 
 		 388 aa  404  1e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0719  biotin synthase  50.9 
 
 		 356 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  47.62 
 
 		 330 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  49.54 
 
 		 337 aa  346  3e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21296  biotin synthase  49.38 
 
 		 437 aa  345  7e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1222  biotin synthase  49.7 
 
 		 329 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.213831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  49.85 
 
 		 332 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  49.85 
 
 		 368 aa  333  4e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  49.69 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  48.75 
 
 		 352 aa  329  5.0000000000000004e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  45.54 
 
 		 335 aa  328  8e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  49.38 
 
 		 346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  49.07 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  49.07 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  49.07 
 
 		 346 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  48.74 
 
 		 374 aa  326  4.0000000000000003e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  48.6 
 
 		 346 aa  325  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  47.52 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  46.29 
 
 		 363 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  48.17 
 
 		 375 aa  323  4e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  47.98 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  47.98 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  47.98 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  48.45 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  47.98 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  47.98 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  47.98 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  47.98 
 
 		 346 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  49.07 
 
 		 345 aa  320  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2539  biotin synthase  48.96 
 
 		 346 aa  320  3e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0270641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  48.44 
 
 		 354 aa  319  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1266  biotin synthase  47.04 
 
 		 346 aa  319  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.537106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4389  biotin synthase  47.69 
 
 		 335 aa  318  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1505  biotin synthase  49.22 
 
 		 345 aa  318  9e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00472809  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  44.93 
 
 		 362 aa  318  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  47.99 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  47.99 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  47.5 
 
 		 345 aa  317  2e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2890  biotin synthase  48.63 
 
 		 338 aa  317  2e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.357161 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1924  biotin synthase  46.09 
 
 		 351 aa  317  2e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00301701 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  47.19 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  45.56 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2844  biotin synthase  48.77 
 
 		 345 aa  316  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  47.26 
 
 		 352 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2964  biotin synthase  48.91 
 
 		 345 aa  316  5e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  47.26 
 
 		 352 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  46.91 
 
 		 326 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  46.65 
 
 		 352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  47.66 
 
 		 362 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4625  biotin synthase  46.18 
 
 		 340 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.970025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1010  biotin synthase  46.42 
 
 		 331 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  48.43 
 
 		 321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  48.43 
 
 		 321 aa  313  3.9999999999999997e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  47.48 
 
 		 353 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  48.42 
 
 		 336 aa  312  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  46.95 
 
 		 352 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  47.04 
 
 		 360 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  48.11 
 
 		 350 aa  312  6.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  48.02 
 
 		 342 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1801  biotin synthase  45.14 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.757767  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  44.34 
 
 		 338 aa  311  1e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  46.88 
 
 		 352 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  47.06 
 
 		 359 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  44.97 
 
 		 354 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  45.95 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  46.88 
 
 		 352 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5062  biotin synthase  45.1 
 
 		 333 aa  310  4e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1795  biotin synthase  46.25 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.46319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  46.88 
 
 		 352 aa  309  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2527  biotin synthase  46.25 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1758  biotin synthase  46.25 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1751  biotin synthase  46.25 
 
 		 350 aa  309  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1167  biotin synthase  47.99 
 
 		 370 aa  308  8e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.893176  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  45.94 
 
 		 350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2442  biotin synthase  47.52 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.167698  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0058  biotin synthase  47.35 
 
 		 334 aa  308  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.618139 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  46.86 
 
 		 350 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  46.39 
 
 		 345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  46.88 
 
 		 352 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  45.94 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  45.94 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  45.94 
 
 		 350 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  46.25 
 
 		 328 aa  306  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  47.09 
 
 		 324 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  45.94 
 
 		 350 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  46.23 
 
 		 350 aa  305  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  46.25 
 
 		 351 aa  305  7e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  45.45 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1719  biotin synthase  47.58 
 
 		 350 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0119643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  46.25 
 
 		 346 aa  305  8.000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  46.23 
 
 		 356 aa  305  9.000000000000001e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  43.34 
 
 		 331 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  46.56 
 
 		 352 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3236  biotin synthase  47.72 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.267885  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  47.32 
 
 		 367 aa  304  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  47.17 
 
 		 345 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  49.23 
 
 		 335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  46.08 
 
 		 351 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>