More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0821 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  100 
 
 		 326 aa  664    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  40.5 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  40.31 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  41.96 
 
 		 345 aa  242  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  38.87 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  40.2 
 
 		 331 aa  239  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  41.12 
 
 		 356 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  38.82 
 
 		 347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  38.66 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  38.06 
 
 		 335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  40.8 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  38.46 
 
 		 349 aa  232  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  37.04 
 
 		 334 aa  231  9e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  40.13 
 
 		 332 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  41.58 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  39.53 
 
 		 331 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  40.07 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  37.18 
 
 		 376 aa  226  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  36.36 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  39.66 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  37.93 
 
 		 331 aa  225  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  41.07 
 
 		 331 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  37.54 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  39.94 
 
 		 344 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  37.99 
 
 		 368 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  38.87 
 
 		 339 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  37.46 
 
 		 332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  40.72 
 
 		 345 aa  222  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  40.91 
 
 		 361 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  38.82 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  36.45 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  39.61 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  38.71 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  36.16 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2776  biotin synthetase  36.89 
 
 		 350 aa  220  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  37.83 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  37.83 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  37.83 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  37.83 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.63 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  37.83 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  36.05 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  36.31 
 
 		 329 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  36.89 
 
 		 345 aa  218  8.999999999999998e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  37.83 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  37.83 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  36.42 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  41.07 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  41.07 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  41.07 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  37.5 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  34.81 
 
 		 364 aa  216  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  36.88 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  39.41 
 
 		 360 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  35.62 
 
 		 320 aa  215  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  38.26 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  38.74 
 
 		 344 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  36.16 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  35.78 
 
 		 375 aa  215  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  38.19 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  36.98 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  34.6 
 
 		 322 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.18 
 
 		 333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  36.02 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  38.76 
 
 		 345 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  38.02 
 
 		 374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0243  biotin synthase  36.89 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  37.46 
 
 		 338 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  35.81 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  37.17 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4292  biotin synthase  40.14 
 
 		 326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  38.76 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  34.27 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  37.97 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3457  biotin synthase  38.44 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000294325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.13 
 
 		 331 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  38.44 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  34.27 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  37.58 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  37.58 
 
 		 352 aa  209  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3827  biotin synthase  38.08 
 
 		 347 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  39.07 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  36.93 
 
 		 332 aa  208  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  37.25 
 
 		 352 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  37.58 
 
 		 345 aa  208  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  37.74 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  34.94 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  35.26 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  38.21 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  37.29 
 
 		 351 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  37.01 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  37.01 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0041  biotin synthase  36.48 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0050  biotin synthase  36.48 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  37.01 
 
 		 350 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  37.38 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  37.38 
 
 		 345 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  34.31 
 
 		 361 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4687  biotin synthase  37.63 
 
 		 352 aa  206  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.747716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  38.11 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>