223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0234 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 358 aa  736    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  98.6 
 
 		 358 aa  730    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  76.04 
 
 		 360 aa  577  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  74.02 
 
 		 360 aa  554  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  74.09 
 
 		 361 aa  551  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  63.59 
 
 		 359 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  63.31 
 
 		 359 aa  486  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  55.11 
 
 		 367 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  55.4 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  57.75 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  53.28 
 
 		 367 aa  413  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  53.11 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  55.06 
 
 		 373 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  52.96 
 
 		 388 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  52.68 
 
 		 388 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  52.39 
 
 		 388 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  50.99 
 
 		 368 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  52.68 
 
 		 387 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  48.87 
 
 		 359 aa  376  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  51.27 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  50.57 
 
 		 373 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  50.71 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  48.85 
 
 		 367 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  47.86 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  49.14 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  48.03 
 
 		 391 aa  352  4e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  47.69 
 
 		 360 aa  346  4e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 		 387 aa  344  1e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  47.58 
 
 		 371 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  45.15 
 
 		 396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  45.68 
 
 		 376 aa  333  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  45.43 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  44.38 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  45.3 
 
 		 386 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 		 393 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  46.8 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 		 389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  42.45 
 
 		 350 aa  319  5e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  42.54 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  43.1 
 
 		 354 aa  317  3e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  45.25 
 
 		 382 aa  316  4e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  43.14 
 
 		 354 aa  314  1.9999999999999998e-84  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  44.89 
 
 		 358 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  44.17 
 
 		 389 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  45.25 
 
 		 392 aa  312  4.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  43.06 
 
 		 353 aa  312  6.999999999999999e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  41.11 
 
 		 360 aa  311  1e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  42.21 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  43.98 
 
 		 397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  42 
 
 		 354 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  42 
 
 		 354 aa  308  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  42.25 
 
 		 354 aa  301  9e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  41.76 
 
 		 355 aa  295  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  43.42 
 
 		 357 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 364 aa  291  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  41.6 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 		 355 aa  288  7e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  41.81 
 
 		 371 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  42.09 
 
 		 357 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  41.09 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  43.79 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  39.2 
 
 		 356 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 365 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  40.22 
 
 		 360 aa  285  8e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  41.19 
 
 		 354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  42.54 
 
 		 360 aa  283  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 375 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 		 354 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  39.72 
 
 		 353 aa  275  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  42.03 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 		 385 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 381 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  38.48 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 367 aa  268  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  38.68 
 
 		 348 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.66 
 
 		 384 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  40.68 
 
 		 355 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  38.68 
 
 		 356 aa  262  8e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  39.07 
 
 		 350 aa  261  8.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  39.27 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.93 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  38.81 
 
 		 404 aa  260  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  38.9 
 
 		 359 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  36.96 
 
 		 352 aa  259  5.0000000000000005e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  38.78 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 		 369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  37.64 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  38.64 
 
 		 376 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  38.14 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.22 
 
 		 363 aa  257  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 515 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 		 353 aa  256  5e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  36.71 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  37.74 
 
 		 399 aa  253  3e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 435 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>