225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3390 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  86.82 
 
 		 354 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  77.34 
 
 		 364 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  75.43 
 
 		 357 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  73.65 
 
 		 357 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  75.29 
 
 		 357 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  75.22 
 
 		 347 aa  511  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  65.44 
 
 		 355 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  58.64 
 
 		 355 aa  426  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  57.43 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  55.43 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  57.1 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  59.71 
 
 		 356 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  54.13 
 
 		 360 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  52.45 
 
 		 371 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  52.01 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  52 
 
 		 625 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  53.8 
 
 		 348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  52.29 
 
 		 626 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  51.3 
 
 		 386 aa  361  1e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  50.43 
 
 		 348 aa  360  2e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  52 
 
 		 626 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  52 
 
 		 626 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  52.01 
 
 		 375 aa  358  6e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 381 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  50.73 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  50.72 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  50.73 
 
 		 363 aa  348  8e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  50.71 
 
 		 355 aa  347  1e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  49.56 
 
 		 348 aa  343  2e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  48.55 
 
 		 356 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 369 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  49.71 
 
 		 350 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  50.72 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  50.72 
 
 		 348 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  46.97 
 
 		 395 aa  329  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  50.43 
 
 		 348 aa  328  7e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  47.79 
 
 		 345 aa  322  5e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  47.93 
 
 		 359 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  47.67 
 
 		 399 aa  318  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  46.33 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  48.99 
 
 		 348 aa  317  3e-85  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  48.86 
 
 		 380 aa  315  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 394 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  44.22 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  44.83 
 
 		 396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.42 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  45.66 
 
 		 515 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  45.72 
 
 		 353 aa  298  1e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  43.18 
 
 		 364 aa  296  4e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  43.62 
 
 		 348 aa  291  9e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  44.81 
 
 		 347 aa  291  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  43.57 
 
 		 374 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  43.58 
 
 		 379 aa  278  8e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.72 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.15 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  41.44 
 
 		 354 aa  271  9e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 		 359 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  42.46 
 
 		 377 aa  271  1e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 360 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 372 aa  266  4e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  41.34 
 
 		 360 aa  265  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 		 368 aa  264  1e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.5 
 
 		 368 aa  264  1e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 358 aa  264  1e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  41.74 
 
 		 393 aa  261  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 367 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 367 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  38.4 
 
 		 365 aa  256  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  39.6 
 
 		 362 aa  255  7e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  39.78 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  42.53 
 
 		 358 aa  250  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  37.25 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 359 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  38.66 
 
 		 353 aa  245  6.999999999999999e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  36.65 
 
 		 353 aa  245  9e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  38.2 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  37.08 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 354 aa  243  5e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  36.36 
 
 		 371 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  37.22 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  38.82 
 
 		 419 aa  239  5e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  36.47 
 
 		 373 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  36.1 
 
 		 370 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  38.38 
 
 		 384 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  36.34 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  37.25 
 
 		 376 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  36.68 
 
 		 359 aa  236  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  37.68 
 
 		 373 aa  234  1.0000000000000001e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  37.12 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  33.99 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  36.52 
 
 		 384 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  36.57 
 
 		 359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>