208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0798 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  766    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  76.36 
 
 
372 aa  590  1e-168  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  75.75 
 
 
387 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  63.54 
 
 
380 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  55.89 
 
 
373 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  50.28 
 
 
367 aa  376  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  50 
 
 
368 aa  365  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  50.14 
 
 
360 aa  363  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  47.08 
 
 
367 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
368 aa  362  8e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  47.08 
 
 
360 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  50.28 
 
 
388 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  50 
 
 
388 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  50 
 
 
388 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  50.58 
 
 
360 aa  352  7e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  49.44 
 
 
361 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
387 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  48.75 
 
 
359 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  48.18 
 
 
362 aa  349  3e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  48.74 
 
 
359 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  49.02 
 
 
358 aa  345  7e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  47.29 
 
 
358 aa  343  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  47.58 
 
 
358 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  45.13 
 
 
367 aa  342  5e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  45.4 
 
 
359 aa  335  5.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  46.15 
 
 
391 aa  332  9e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 
373 aa  331  1e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  44.69 
 
 
376 aa  331  1e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  46.07 
 
 
367 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  44.57 
 
 
396 aa  319  5e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  46.78 
 
 
373 aa  318  1e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  46.48 
 
 
386 aa  315  9.999999999999999e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  45.22 
 
 
384 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  41.88 
 
 
350 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  44.04 
 
 
382 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  42.54 
 
 
354 aa  298  9e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  43.49 
 
 
392 aa  296  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  40.96 
 
 
353 aa  292  5e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  42.34 
 
 
386 aa  292  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 
389 aa  290  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  40.85 
 
 
364 aa  290  4e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 
365 aa  290  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  39.5 
 
 
354 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  41 
 
 
393 aa  287  2e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 
389 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  40.33 
 
 
390 aa  286  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  39.72 
 
 
360 aa  285  7e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  39.39 
 
 
354 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  39.09 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  41.01 
 
 
353 aa  280  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.6 
 
 
358 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  39.11 
 
 
354 aa  280  3e-74  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  38.38 
 
 
354 aa  278  1e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 
355 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  39.72 
 
 
397 aa  275  9e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 
381 aa  272  7e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  41.55 
 
 
360 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  41.31 
 
 
386 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  40.78 
 
 
355 aa  261  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 
354 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  40.96 
 
 
375 aa  258  9e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  39.61 
 
 
371 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  39.11 
 
 
355 aa  250  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  36.71 
 
 
348 aa  250  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  37.94 
 
 
369 aa  249  5e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  37.13 
 
 
345 aa  249  8e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  38.5 
 
 
357 aa  248  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  38.2 
 
 
357 aa  248  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  36.69 
 
 
360 aa  247  2e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  37.61 
 
 
376 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 
356 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  36.47 
 
 
352 aa  243  5e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  36.36 
 
 
353 aa  242  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  36.6 
 
 
348 aa  241  1e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 
419 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  37.43 
 
 
359 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  36.59 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.61 
 
 
363 aa  239  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  37.43 
 
 
359 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  38.74 
 
 
364 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 
372 aa  238  9e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  36.67 
 
 
384 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  35.26 
 
 
370 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 
626 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 
626 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  37.08 
 
 
626 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 
362 aa  236  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  36.75 
 
 
354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  38.96 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  38.31 
 
 
367 aa  236  6e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  34.77 
 
 
350 aa  235  7e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.22 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  35.5 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 
625 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  35.99 
 
 
402 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 
355 aa  233  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  34.97 
 
 
362 aa  233  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 
364 aa  232  8.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 
348 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 
353 aa  230  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>