217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0701 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 374 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  73.53 
 
 		 374 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  46.39 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  45.15 
 
 		 371 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  46.8 
 
 		 625 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  48.57 
 
 		 360 aa  321  9.999999999999999e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  48.69 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 354 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 		 369 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  46.27 
 
 		 381 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  46.22 
 
 		 356 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  46.27 
 
 		 375 aa  309  5.9999999999999995e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 		 626 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 		 626 aa  306  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  45.07 
 
 		 626 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  45.61 
 
 		 358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  41.34 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  44.57 
 
 		 360 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  44.09 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  43.73 
 
 		 363 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 385 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 		 345 aa  296  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 396 aa  295  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  43.23 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  43.85 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 		 352 aa  293  4e-78  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  42.65 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  42.02 
 
 		 515 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  43.44 
 
 		 357 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  38.94 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  43.3 
 
 		 380 aa  290  4e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  44.34 
 
 		 355 aa  288  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  43.4 
 
 		 353 aa  286  4e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  42.73 
 
 		 357 aa  285  8e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  42.65 
 
 		 348 aa  285  9e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  43.1 
 
 		 350 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  42.74 
 
 		 355 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 		 354 aa  279  7e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  40.95 
 
 		 359 aa  276  5e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  41.62 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  43.23 
 
 		 348 aa  270  4e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  43.23 
 
 		 348 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  43.23 
 
 		 348 aa  269  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  40.58 
 
 		 357 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  38.36 
 
 		 404 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  39.84 
 
 		 379 aa  266  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  38.48 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  42.55 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  41.5 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 		 372 aa  252  9.000000000000001e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 364 aa  248  1e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  38.69 
 
 		 348 aa  235  8e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  39.88 
 
 		 353 aa  232  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  34.71 
 
 		 354 aa  231  1e-59  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  37.36 
 
 		 393 aa  231  1e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  37.93 
 
 		 384 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  34.26 
 
 		 359 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  34.88 
 
 		 396 aa  229  7e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 358 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  36.49 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 391 aa  223  4.9999999999999996e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  35.13 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 		 373 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  34.35 
 
 		 367 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  33.33 
 
 		 356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  33.88 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  33.79 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  33.72 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  33.24 
 
 		 376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  33.43 
 
 		 358 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 		 365 aa  212  7.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  32.96 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.39 
 
 		 453 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  32.4 
 
 		 367 aa  209  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  35.92 
 
 		 356 aa  209  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  35.46 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  30.85 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  32.96 
 
 		 387 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  33.24 
 
 		 373 aa  206  4e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  33.8 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  34.81 
 
 		 944 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  31.86 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 362 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  34.14 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  34.08 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  34.49 
 
 		 353 aa  204  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  35.12 
 
 		 792 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  34.6 
 
 		 841 aa  203  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  32.41 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  33.33 
 
 		 359 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  34.96 
 
 		 899 aa  202  7e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>