214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1280 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 381 aa  791    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  71.92 
 
 		 386 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  72.88 
 
 		 375 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  68.99 
 
 		 371 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  65.22 
 
 		 354 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  57.82 
 
 		 369 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  55.22 
 
 		 345 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  56.3 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  56.38 
 
 		 360 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  55.59 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  54.52 
 
 		 625 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  52.77 
 
 		 358 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  52.62 
 
 		 626 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  52.62 
 
 		 626 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  52.62 
 
 		 626 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  50.57 
 
 		 355 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  50 
 
 		 353 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  47.98 
 
 		 350 aa  351  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  51.86 
 
 		 356 aa  351  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  50.58 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  47.8 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  49.27 
 
 		 363 aa  350  2e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  46.94 
 
 		 352 aa  348  8e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  48.1 
 
 		 354 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  50.86 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  46.94 
 
 		 357 aa  346  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  46.36 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 		 364 aa  342  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  48.09 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  47.83 
 
 		 349 aa  339  5e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  47.89 
 
 		 360 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  43.3 
 
 		 356 aa  332  1e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  46.67 
 
 		 348 aa  329  6e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  45.83 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  46.67 
 
 		 348 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  48.09 
 
 		 348 aa  328  9e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  44.93 
 
 		 395 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  47.62 
 
 		 357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  46.67 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  47.92 
 
 		 347 aa  325  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  47.98 
 
 		 380 aa  323  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  45.93 
 
 		 396 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  45.34 
 
 		 359 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  45.82 
 
 		 374 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  46.27 
 
 		 374 aa  312  7.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  44.99 
 
 		 515 aa  311  1e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 404 aa  310  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  45.98 
 
 		 377 aa  310  2.9999999999999997e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  45.06 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  42.12 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  46.52 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  43.28 
 
 		 399 aa  299  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  43.06 
 
 		 393 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  42.34 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  41.91 
 
 		 368 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.39 
 
 		 347 aa  277  3e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 		 358 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  42.94 
 
 		 387 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  40.69 
 
 		 371 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 		 358 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  41.14 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 		 360 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  40.96 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  41.38 
 
 		 388 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 372 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  41.09 
 
 		 388 aa  269  7e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  40.8 
 
 		 388 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.82 
 
 		 360 aa  266  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  43.91 
 
 		 358 aa  266  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  39.14 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  39.07 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.39 
 
 		 372 aa  260  3e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  39.71 
 
 		 354 aa  259  6e-68  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  37.85 
 
 		 359 aa  255  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.18 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  35.96 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  35.46 
 
 		 367 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 368 aa  249  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  39.77 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 435 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.29 
 
 		 453 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  36.95 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 386 aa  243  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  37.1 
 
 		 359 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  37.2 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  38.59 
 
 		 373 aa  241  2e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  35.39 
 
 		 359 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  37.78 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  38.7 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  39.44 
 
 		 792 aa  240  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  38.6 
 
 		 358 aa  239  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  36.95 
 
 		 429 aa  239  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  37.72 
 
 		 384 aa  238  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  37.71 
 
 		 382 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 353 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>