221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1272 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 355 aa  729    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  59.82 
 
 		 354 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  56.73 
 
 		 375 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  57.77 
 
 		 386 aa  408  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  56.5 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  56.9 
 
 		 358 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  55.07 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  58.09 
 
 		 360 aa  404  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  57.69 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  54.11 
 
 		 355 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  56.51 
 
 		 381 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  54.44 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  55.93 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  52.01 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  52.01 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  51.44 
 
 		 626 aa  363  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  51.59 
 
 		 625 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  48.58 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  53.1 
 
 		 357 aa  355  5e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  51.14 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  52.45 
 
 		 360 aa  354  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  52.87 
 
 		 355 aa  353  2e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  50.86 
 
 		 357 aa  349  4e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  50.71 
 
 		 353 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  50.43 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  48.7 
 
 		 352 aa  342  5.999999999999999e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  49.29 
 
 		 364 aa  342  8e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  49.13 
 
 		 348 aa  340  2e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  48.84 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  53.43 
 
 		 402 aa  338  8e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  46.54 
 
 		 363 aa  333  2e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  51.16 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  51.33 
 
 		 347 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  50.29 
 
 		 348 aa  332  9e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  49.42 
 
 		 349 aa  331  1e-89  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  50 
 
 		 348 aa  328  6e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  49.71 
 
 		 348 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  47.69 
 
 		 359 aa  324  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  47.83 
 
 		 350 aa  323  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  49.56 
 
 		 348 aa  322  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  45.48 
 
 		 395 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  46 
 
 		 396 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  45.74 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  46.02 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  44.63 
 
 		 515 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 404 aa  300  3e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 368 aa  297  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 358 aa  288  7e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  44.01 
 
 		 368 aa  288  9e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  42.05 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  43.89 
 
 		 374 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  43.56 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  42.74 
 
 		 374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  44.96 
 
 		 359 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  41.55 
 
 		 360 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 		 367 aa  276  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  42.58 
 
 		 377 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  44.67 
 
 		 362 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  41.83 
 
 		 360 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  43.33 
 
 		 359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  41.71 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 		 348 aa  267  2e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 		 353 aa  265  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  42.18 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  39.04 
 
 		 367 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 		 359 aa  262  4.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  40.23 
 
 		 373 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 367 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  41.86 
 
 		 347 aa  260  3e-68  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 358 aa  257  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  41.74 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  40.23 
 
 		 373 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  44.52 
 
 		 856 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  37.57 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  37.81 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  44.19 
 
 		 859 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  38.57 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  39.12 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  37.57 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  40.75 
 
 		 372 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  40.12 
 
 		 380 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  44.3 
 
 		 859 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  44.3 
 
 		 859 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  44.19 
 
 		 859 aa  246  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  44.3 
 
 		 859 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  38.14 
 
 		 354 aa  245  6.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 365 aa  245  8e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  37.57 
 
 		 354 aa  245  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  38.78 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  38.35 
 
 		 354 aa  242  9e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  37.75 
 
 		 386 aa  241  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  37.75 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  37.67 
 
 		 388 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  37.67 
 
 		 388 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>