219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2881 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  726    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  53.67 
 
 
360 aa  371  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  53.76 
 
 
354 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  52.63 
 
 
364 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  54.12 
 
 
360 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  56.1 
 
 
625 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  53.8 
 
 
353 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  51.61 
 
 
355 aa  359  4e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  51.9 
 
 
357 aa  358  7e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  51.32 
 
 
358 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  51.02 
 
 
357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  51.32 
 
 
357 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  51.91 
 
 
355 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  52.49 
 
 
626 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  51.2 
 
 
352 aa  346  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  52.49 
 
 
626 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  52.49 
 
 
626 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  53.67 
 
 
356 aa  343  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  50.29 
 
 
349 aa  342  4e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  49.41 
 
 
345 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  51.18 
 
 
375 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  49.71 
 
 
371 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  48.25 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  49.56 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  48.84 
 
 
395 aa  337  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  51.92 
 
 
354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  48.24 
 
 
369 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  52.06 
 
 
402 aa  335  9e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  48.25 
 
 
363 aa  334  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 
515 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  51.52 
 
 
347 aa  328  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  50.29 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  48.09 
 
 
381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  47.08 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  47.29 
 
 
399 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  47.08 
 
 
350 aa  325  9e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  47.51 
 
 
356 aa  323  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  49.56 
 
 
355 aa  322  8e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  46.47 
 
 
385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  49.42 
 
 
348 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  49.12 
 
 
348 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  49.12 
 
 
348 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  47.95 
 
 
348 aa  311  1e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  45.06 
 
 
359 aa  311  1e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  51.13 
 
 
380 aa  308  5.9999999999999995e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  45.32 
 
 
394 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 
404 aa  300  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  41.47 
 
 
354 aa  288  1e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  42.73 
 
 
368 aa  273  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  41.62 
 
 
374 aa  271  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  41.33 
 
 
374 aa  268  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  41.93 
 
 
377 aa  265  5.999999999999999e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  43.96 
 
 
379 aa  263  4.999999999999999e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 
367 aa  260  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 
373 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  37.72 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  38.84 
 
 
388 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  39.23 
 
 
388 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 
360 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.37 
 
 
360 aa  250  3e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  38.01 
 
 
367 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.35 
 
 
359 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 
359 aa  246  4e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
361 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  35.94 
 
 
358 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  43.17 
 
 
356 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 
358 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  37.92 
 
 
419 aa  242  6e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 
358 aa  242  7e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  41.85 
 
 
393 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  38.48 
 
 
367 aa  238  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  37.11 
 
 
359 aa  237  2e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  39.13 
 
 
376 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.79 
 
 
368 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 
358 aa  235  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  36.84 
 
 
364 aa  232  6e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  36.65 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  38.95 
 
 
362 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.53 
 
 
373 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  41.64 
 
 
792 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
365 aa  230  3e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  36.5 
 
 
347 aa  230  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  36.57 
 
 
370 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  37.04 
 
 
359 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.92 
 
 
453 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  36.6 
 
 
391 aa  228  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  36.23 
 
 
348 aa  227  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  36.61 
 
 
364 aa  227  3e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  36 
 
 
359 aa  225  7e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 
353 aa  225  8e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  36.71 
 
 
371 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  35.34 
 
 
353 aa  223  3e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  37.96 
 
 
435 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  36.63 
 
 
372 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 
359 aa  222  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>